[发明专利]用于拼接的基于分块的局部配准以及全局放置在审
申请号: | 201880024039.3 | 申请日: | 2018-04-06 |
公开(公告)号: | CN110494891A | 公开(公告)日: | 2019-11-22 |
发明(设计)人: | J·马丁;A·萨卡尔 | 申请(专利权)人: | 文塔纳医疗系统公司 |
主分类号: | G06T3/40 | 分类号: | G06T3/40;G06T7/38;G06T7/12 |
代理公司: | 11494 北京坤瑞律师事务所 | 代理人: | 岑晓东<国际申请>=PCT/EP2018 |
地址: | 美国亚*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分块图像 空间关系 得分确定 多分辨率 所述空间 文本提供 相邻灰度 最小二乘 归一化 互相关 配准 权重 加权 拼接 全局 扫描 | ||
1.一种拼接承载样品的载玻片的分块图像的方法,所述方法包括:
(a)导出所述承载样品的载玻片的每个分块图像的灰度分块图像;
(b)执行局部配准以确定相邻灰度分块图像对之间的空间关系,所述空间关系是使用在多分辨率框架内计算的归一化互相关(NCC)得分确定的;以及
(c)执行全局放置以相对于彼此定位所有扫描的分块图像,其中,所述全局放置是利用所有相邻灰度分块图像之间的确定的空间关系并且利用所述NCC得分作为权重通过加权最小二乘确定的。
2.根据权利要求1的方法,其中,通过以下操作来确定每对相邻灰度分块图像的所述空间关系:(i)计算第一低分辨率子采样图像和第二低分辨率子采样图像中的预期匹配区域之间的候选空间关系,所述第一低分辨率子采样图像和所述第二低分辨率子采样图像是从相邻灰度分块图像的重叠区域导出的;(ii)在顺序更精细分辨率子采样图像中改善所述候选空间关系;以及(iii)选择在原始分辨率下在所述相邻灰度分块图像对的所述重叠区域中具有最高NCC得分的经过改善的候选空间关系作为所述确定的空间关系。
3.根据权利要求2的方法,其中,通过确定所述第一低分辨率子采样图像和所述第二低分辨率子采样图像中的NCC域中的峰值的位置来导出所述第一低分辨率子采样图像与所述第二低分辨率子采样图像之间的所述候选空间关系。
4.根据权利要求3的方法,其中,保留所述候选空间关系,所述候选空间关系的峰值位置满足预定义NCC阈值。
5.根据权利要求4的方法,其中,所述预定义NCC阈值是最高NCC得分的预定义百分比。
6.根据权利要求3的方法,其中,通过确定所述NCC域中的每个峰值的更新位置来改善所述候选空间关系,其中,每个峰值的所述位置的更新是在顺序更精细分辨率子采样图像对中执行的,每对顺序更精细分辨率子采样图像对应于所述相邻灰度分块图像对的所述重叠区域。
7.根据权利要求6的方法,其中,与紧接较低分辨率子采样图像相比,每对顺序更精细分辨率子采样图像包括下采样因子的预定减小,直到达到下采样因子1。
8.根据权利要求7的方法,其中,所述下采样因子的变化范围为2到4。
9.根据权利要求6的方法,其中,所述第一子采样图像和所述第二子采样图像具有用于提供第一分辨率的第一下采样因子;并且在本文中,第一对顺序更精细分辨率子采样图像的分辨率是所述第一分辨率的分辨率的两倍。
10.根据权利要求6的方法,其中,使用所有子采样图像分辨率的积分图像计算所述NCC得分。
11.根据权利要求6的方法,其中,使用至少一个子采样图像分辨率的积分图像计算所述NCC得分。
12.根据权利要求1的方法,其中,使用预先计算的积分图像计算所述NCC得分。
13.根据权利要求2的方法,其还包括计算所述相邻灰度分块图像对中的匹配区域之间的标准偏差的步骤。
14.根据权利要求1的方法,其中,相邻灰度分块图像之间的所述空间关系是分块重叠和分块移位。
15.根据权利要求14的方法,其中,计算所有水平分块图像对和所有竖直分块图像对的分块移位值和分块重叠值。
16.根据权利要求14的方法,其还包括确定相邻灰度分块图像对之间的所述分块重叠值和所述分块移位值是否可靠。
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