[发明专利]使用ILV3基因的微生物的检测和划分在审
申请号: | 201880024658.2 | 申请日: | 2018-04-11 |
公开(公告)号: | CN110546279A | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
发明(设计)人: | 安得烈·罗杰斯 | 申请(专利权)人: | 动力生物科学有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 11258 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 赵萌<国际申请>=PCT/GB2018/ |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 英国;GB |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 真菌 酵母感染 核酸扩增反应 检测扩增产物 检测样品 试剂盒 扩增 探针 引物 酵母 基因 | ||
1.一种检测样品中真菌/酵母感染的方法,所述方法包括:
a.执行核酸扩增反应以扩增真菌/酵母的ILV3基因
b.检测扩增产物以确定所述样品是否含有真菌/酵母感染。
2.一种检测样品中真菌/酵母感染的方法,所述方法包括:
a.执行包含以下组分的核酸扩增反应:
i.与Candida物种的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Candida物种的ILV3基因特异性杂交的探针;和
ii.与Aspergillus物种的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Aspergillus物种的ILV3基因特异性杂交的探针;和/或
iii.与Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的探针
b.检测扩增产物以确定所述样品是否含有真菌/酵母感染。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述核酸扩增反应扩增以下物种中的至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种或所有12种物种的ILV3基因:
i.Candida albicans
ii.Candida dubliniensis
iii.Candida tropicalis
iv.Candida parapsilosis
v.Candida glabrata
vi.Candida krusei
vii.Candida guilliermondii
viii.Candida auris
ix.Aspergillus fumigatus
x.Aspergillus niger
xi.Aspergillus flavus
xiiCryptococcus neoformans。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中步骤a包括:
i.使用与Candida物种、Aspergillus物种和/或Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物;和/或
ii.使用与Candida物种、Aspergillus物种和/或Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的探针。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中共用的正向引物和反向引物和/或共用的探针与以下Candida物种中的至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种,以及优选所有物种的ILV3基因杂交:
i.Candida albicans
ii.Candida dubliniensis
iii.Candida tropicalis
iv.Candida parapsilosis
v.Candida glabrata
vi.Candida krusei
vii.Candida guilliermondii
viii.Candida auris;
和/或其中共用的正向引物和反向引物和/或探针与以下Aspergillus物种中的至少2种,以及优选所有3种物种的ILV3基因杂交:
i.Aspergillus fumigatus
ii.Aspergillus niger
iii.Aspergillus flavus。
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