[发明专利]使用ILV3基因的微生物的检测和划分在审

专利信息
申请号: 201880024658.2 申请日: 2018-04-11
公开(公告)号: CN110546279A 公开(公告)日: 2019-12-06
发明(设计)人: 安得烈·罗杰斯 申请(专利权)人: 动力生物科学有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 11258 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 代理人: 赵萌<国际申请>=PCT/GB2018/
地址: 英国*** 国省代码: 英国;GB
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摘要:
搜索关键词: 真菌 酵母感染 核酸扩增反应 检测扩增产物 检测样品 试剂盒 扩增 探针 引物 酵母 基因
【权利要求书】:

1.一种检测样品中真菌/酵母感染的方法,所述方法包括:

a.执行核酸扩增反应以扩增真菌/酵母的ILV3基因

b.检测扩增产物以确定所述样品是否含有真菌/酵母感染。

2.一种检测样品中真菌/酵母感染的方法,所述方法包括:

a.执行包含以下组分的核酸扩增反应:

i.与Candida物种的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Candida物种的ILV3基因特异性杂交的探针;和

ii.与Aspergillus物种的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Aspergillus物种的ILV3基因特异性杂交的探针;和/或

iii.与Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物,任选地以及在引物结合位点之间与Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的探针

b.检测扩增产物以确定所述样品是否含有真菌/酵母感染。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述核酸扩增反应扩增以下物种中的至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种或所有12种物种的ILV3基因:

i.Candida albicans

ii.Candida dubliniensis

iii.Candida tropicalis

iv.Candida parapsilosis

v.Candida glabrata

vi.Candida krusei

vii.Candida guilliermondii

viii.Candida auris

ix.Aspergillus fumigatus

x.Aspergillus niger

xi.Aspergillus flavus

xiiCryptococcus neoformans。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中步骤a包括:

i.使用与Candida物种、Aspergillus物种和/或Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的正向引物和反向引物;和/或

ii.使用与Candida物种、Aspergillus物种和/或Cryptococcus neoformans的ILV3基因特异性杂交的探针。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中共用的正向引物和反向引物和/或共用的探针与以下Candida物种中的至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种,以及优选所有物种的ILV3基因杂交:

i.Candida albicans

ii.Candida dubliniensis

iii.Candida tropicalis

iv.Candida parapsilosis

v.Candida glabrata

vi.Candida krusei

vii.Candida guilliermondii

viii.Candida auris;

和/或其中共用的正向引物和反向引物和/或探针与以下Aspergillus物种中的至少2种,以及优选所有3种物种的ILV3基因杂交:

i.Aspergillus fumigatus

ii.Aspergillus niger

iii.Aspergillus flavus。

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