[发明专利]通过细菌宏基因组分析来诊断帕金森氏病的方法

权利要求书

1.一种为帕金森氏病诊断提供信息的方法，该方法包括：

(a)从分离自受试者样品的细胞外囊泡中提取DNA；

(b)使用具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所提取的所述DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及

(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、互养菌门(Synergistetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、OD1门、WS3门、奇古菌门(Parvarchaeota)、OP1门、绿菌门(Chlorobi)、OP9门、Hyd24-12门和热袍菌门(Thermotogae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由红蝽菌纲(Coriobacteriia)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、放线菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、叶绿体纲(Chloroplast)、腐螺旋菌纲(Saprospirae)、δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)、Ellin6529纲、氯酸杆菌纲(Chloracidobacteria)、丰佑菌纲(Opitutae)、嗜热油菌纲(Thermoleophilia)、互营养菌纲(Synergistia)、芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)、浮霉菌纲(Planctomycetia)、嗜酸杆菌纲(Acidobacteriia)、索利氏菌纲(Solibacteres)、厌氧绳菌纲(Anaerolineae)、绿弯菌纲(Chloroflexi)、菲西芬氏菌纲(Phycisphaerae)、聚球藻菌纲(Synechococcophycideae)、TM7-1纲、酸微菌纲(Acidimicrobiia)、酸杆菌-6纲(Acidobacteria-6)、斯巴达杆菌纲(Spartobacteria)、ABY1纲、土圈菌纲(Pedosphaerae)、ZB2纲、PRR-12纲、纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)、JS1纲、WM88纲、脱卤拟球菌纲(Dehalococcoidetes)、SAR202纲和MSBL6纲组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。