[发明专利]检测HPV诱导的浸润性癌症、非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症以及它们的高级前体病变的甲基化分类器

权利要求书

1.一种用于检测HPV诱导的高级癌前病变和HPV诱导的浸润性癌症以及非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症的方法，所述方法包括检测细胞中的由LHX8、ASCL1和ST6GALNAC5序列组成的甲基化分类器，由此这种超甲基化指示存在具有浸润性潜力的HPV诱导的前体病变、HPV诱导的浸润性癌症以及非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述HPV诱导的高级癌前病变或HPV诱导的浸润性癌症是高级恶变前宫颈病变或浸润性宫颈癌症。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述HPV诱导的浸润性癌症是高风险HPV诱导的浸润性癌症。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述非HPV诱导的妇科癌症是子宫内膜癌症或卵巢癌症。

5.用于检测外阴癌症和具有浸润性潜力的外阴HPV诱导的前体病变的方法，所述方法包括检测细胞中的由ZIC1、ZNF-582和LHX8序列中的一个或多个，以及ASCL1组成的甲基化分类器，由此这种超甲基化指示存在外阴癌症和具有浸润性潜力的外阴HPV诱导的前体病变。

6.用于检测肛门癌症和具有浸润性潜力的肛门HPV诱导的前体病变的方法，所述方法包括检测细胞中的由ZIC1和ZNF-582序列中的一个或多个，以及ASCL1组成的甲基化分类器，由此这种超甲基化指示存在肛门癌症和具有浸润性潜力的肛门HPV诱导的前体病变。

7.用于检测卵巢癌症和卵巢前体病变的方法，所述方法包括检测细胞中的由LHX8和ZIC1序列中的一个或多个，以及ASCL1组成的甲基化分类器，由此这种超甲基化指示存在卵巢癌症和卵巢前体病变。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中在如图1、2、3、7和8中所指示的富含CpG的序列中检测所述超甲基化。

9.根据权利要求1-4中任一项所述的检测HPV诱导的高级癌前病变和HPV诱导的浸润性癌症以及非HPV诱导的妇科癌症或肛门生殖器癌症的方法，或根据权利要求5所述的检测外阴癌症和具有浸润性潜力的外阴HPV诱导的前体病变的方法，和/或根据权利要求6所述的检测肛门癌症和具有浸润性潜力的肛门HPV诱导的前体病变的方法，和/或用于检测卵巢癌症和卵巢前体病变的方法，其中所述超甲基化是与可比较的正常细胞相比，测试细胞中甲基化分类器LHX8、ASCL1、ZNF-582、ZIC1和/或ST6GALNAC5富含CpG的启动子和/或基因序列的增加的甲基化。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中试剂是选自由BssHII、MspI、NotI和HpaII组成的组中的甲基化敏感性限制性核酸内切酶。

11.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述方法涉及纳米技术，优选芯片上实验室技术。

12.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中进行甲基化特异性PCR，所述甲基化特异性PCR基于DNA的亚硫酸氢盐修饰，然后是靶向富含CpG的序列的特异性PCR反应。

13.根据权利要求12所述的方法，其中所述试剂是与如图1或2所指示的核酸结合的核酸探针或引物。

14.根据权利要求13所述的方法，其中所述核酸探针或引物具有可检测的标记。