[发明专利]用于诊断和治疗炎性肠病的方法

说明书

本文描述了用于在患有炎性肠病(IBD)的受试者中测试生物标志物的方法和材料。这种检测可用于诊断和治疗溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩氏病(CD)，它们是否则难以区分的两种形式的IBD。所述方法包括测量在UC和CD患者中差异表达的几种生物标志物(包括HD5或MMP‑7)中一种或多种的水平。治疗可基于受试者患有溃疡性结肠炎还是克罗恩氏病的确定。

相关申请的交叉参考

本申请引用了2017年3月23日提交的美国专利申请第62/475506号(目前待决)的优先权，其内容通过参考以其全部结合至本文中。

关于联邦政府赞助的研究或开发的声明

本发明在National Institute of Health授予的资助号R21DK095186、U54CA091408-09S1、U54CA091408-09S2、U54RR026140、U54MD007593、UL1RR024975、UL1TR000445、G12MD007586、U54CA163069、R24 DA036420和S10RR0254970下，在政府支持下进行。政府拥有本发明的某些权利。

在这种情况下，“政府”是指美利坚合众国政府。

公开背景

炎性肠病(“IBD”)为全部或部分消化道的慢性复发性炎症。IBD有两种类型，即溃疡性结肠炎(“UC”)和克罗恩氏病(“CD”)。仅涉及结肠的克罗恩氏病称为克罗恩结肠炎(“CC”)。当对UC或CC的标准已建立了非确定性评估时，将其标记为“未定型结肠炎(IC)”。UC导致结肠和直肠的粘膜和在较小程度上粘膜下层衬里的炎症和溃疡。CC与UC的不同之处在于，CC可能导致在所有4个结肠层内更深的炎症(透壁性炎症和跳跃性病变)。此外，CC还可能通过成瘘影响其他器官。

UC和CD仅在美国就影响估计200万人，相关的年度健康护理费用超过68亿美元。尽管UC和CD两者均为IBD的类型，但UC或CD患者之间的差异具有重要意义。目前，临床医师为了诊断CD和UC而对IBD患者使用不准确的组合分类(包括临床、内窥镜检查、放射学和组织病理学)。尽管如此，在患有IBD的患者中区分UC或CD患者仍然具有挑战性，以至于难以归类为UC或CD的IBD患者的病例被归类为未定型结肠炎(“IC”)。尽管使用了应用临床、内窥镜检查、放射学和组织学工具的最先进分类系统，但仍有IBD患者的显著亚组被误诊或延迟了正确诊断。实际上，据估计30%患有IBD的患者目前无法准确诊断为CD或UC。

另外，在经受回肠贮袋肛门吻合术的结肠IDB病例中有15%被诊断为UC，随后将基于其术后随访、临床和组织病理学改变以及回肠贮袋中新生CD的发展将其初始诊断改为CD。回肠贮袋肛门吻合术为一种通常适合于UC但不适合于CD的治疗，在手术切除结肠和直肠之后恢复胃肠道的连续性，并涉及创建小肠贮袋以重建切除的直肠。

区分UC和CD病例的意义包括选择医学治疗、手术时机、预后、是否为患者提供回肠贮袋肛门吻合术以及生活方式期望。由于这些原因，需要改进患有IBD的受试者的诊断和随后治疗。

概述

已经发现潘氏细胞分泌的DEFA5 (也称为HD5)用作用于确定患有IBD的患者是否患有UC或CD的生物标志物。

在第一方面，公开了一种在患有IBD或处于其风险下的患者中测量DEFA5 (HD5)的方法，所述方法包括：从患者获得样品；和测量样品中DEFA5 (HD5)的表达和DEFA5 (HD5)的浓度中的至少一种。

在第二方面，公开了一种治疗患有IBD或处于其风险下的患者的方法，所述方法包括：从患者获得样品；测量样品中DEFA5 (HD5)的表达和DEFA5 (HD5)的浓度中的至少一种；和对患者进行干预以治疗克罗恩氏病和溃疡性结肠炎中的一种。

在第三方面，公开了一种在患有IBD或处于其风险下的患者中测量MMP-7的方法，所述方法包括：从患者获得样品；和测量样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种。