[发明专利]使用组合的核酸酶、连结酶、聚合酶以及测序反应测定核酸序列、表达、拷贝数或甲基化变化的装置、方法以及系统在审

专利信息
申请号: 201880034449.6 申请日: 2018-03-29
公开(公告)号: CN110769925A 公开(公告)日: 2020-02-07
发明(设计)人: F·巴拉尼 申请(专利权)人: 康奈尔大学
主分类号: B01F13/00 分类号: B01F13/00;B01L3/00;C12M1/00;C12M1/34;C12M1/40
代理公司: 11517 北京市君合律师事务所 代理人: 赵昊;顾云峰
地址: 美国*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 非侵入性 剪接 循环肿瘤细胞 早期癌症检测 特异性靶向 血细胞 癌症预后 测序反应 分子分析 高灵敏度 疾病复发 监测癌症 人基因组 使用空间 治疗功效 循环DNA 核酸酶 甲基化 聚合酶 拷贝数 无细胞 转录组 可变 微RNA 可用 易位 突变 连结 血液
【权利要求书】:

1.一种用于鉴定样品中的多个核酸分子的系统,所述系统包括:

入口孔,和

筒柱,所述筒柱限定含有以下部分的空间:

多个初级反应室,所述多个初级反应室流体连接至所述入口孔以从所述入口孔接收材料并且由所述材料产生初级反应室产物,以及

产物捕获外壳,所述产物捕获外壳用多个产物捕获亚单元的多个单独列包围固体支撑物,每个单独产物捕获亚单元包括由疏水表面隔开的多个个别亲水微孔隙或微孔的阵列,初级反应产物在所述多个个别亲水微孔隙或微孔中进一步反应以形成在所述微孔隙或所述微孔中检测的阵列产物,其中单独产物捕获亚单元的所述列中的一者或多者接收已穿过所述多个初级反应室中的一者的材料。

2.如权利要求1所述的系统,其还包括:

出口,所述出口用于将材料从所述产物捕获外壳排出。

3.如权利要求1所述的系统,其中由所述筒柱限定的所述空间还包括:

一个或多个初始反应室,所述入口孔将材料排入所述一个或多个初始反应室并且材料从所述一个或多个初始反应室排入所述多个初级反应室。

4.如权利要求1所述的系统,其中由所述筒柱限定的所述空间还包括:

多个二级反应室,其中一者或多者流体连接至所述多个初级反应室中的一者以从所述多个初级反应室中的一者接收材料,以及

多个混合室,所述多个混合室各自流体连接至所述多个二级反应室中的一者以从所述多个二级反应室中的一者接收材料并且将材料排放至所述产物捕获外壳,使得单独产物捕获亚单元的每一列流体连接至所述一个或多个混合室中的一者以从所述一个或多个混合室中的一者接收材料。

5.如权利要求4所述的系统,其中所述多个初级反应室和二级反应室中的至少一些被配置成维持所述多个初级反应室和二级反应室中的液体槽。

6.如权利要求4所述的系统,其中所述多个初级反应室和二级反应室各自具有内部挡板以维持所述多个初级反应室和二级反应室中的液体槽。

7.如权利要求4所述的系统,其中所述多个初级和/或二级反应室各自具有一个或多个内部挡板以维持所述多个初级和二级反应室中的多个液体槽。

8.如权利要求4所述的系统,其中所述混合室中的每一者包括从材料进入所述混合室处的近端延伸至材料离开所述混合室处的近端的分隔物。

9.如权利要求4所述的系统,其中所述混合室中的每一者包括高度疏水的第一表面以及与所述第一表面隔开并且与所述第一表面相比疏水性较差的第二表面,其中所述第一表面和所述第二表面从材料进入所述混合室处的近端延伸至材料离开所述混合室处的近端。

10.如权利要求4所述的系统,其中所述初级反应室和/或所述二级反应室包括内表面,寡核苷酸引物或探针可点样于所述内表面上。

11.如权利要求1所述的系统,其中所述产物捕获亚单元包括多个个别微孔隙的阵列,所述多个个别微孔隙各自具有相对的第一开放末端和第二开放末端,所述第一末端具有大直径并且所述第二末端具有比所述第一末端小的直径。

12.如权利要求11所述的系统,其还包括:

网筛,所述网筛覆盖所述产物捕获外壳中的所述微孔隙的所述第二末端。

13.如权利要求11所述的系统,其还包括:

放置于所述个别微孔隙中的珠粒。

14.如权利要求1所述的系统,其中所述产物捕获亚单元包括多个个别微孔的阵列,所述多个个别微孔各自具有开放末端和封闭末端。

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