[发明专利]多参数定量生物学数据的动态交互显示

说明书

描述了为高参数数据提供交互式可视化的同步显示的数据可视化特征。可视化特征包括以保持参数与相关细胞群之间的上下文关系的交互方式用每个参数的相关统计数据同时图形化地表示多个参数。可视化特征可用于显示高参数多色流式细胞术或基因组数据集。

相关申请的交叉引用

本申请要求2017年7月18日提交的美国临时申请号62/534003的优先权，所述临时申请通过引用整体并入。本申请要求2017年12月20日提交的美国临时申请号62/608200的优先权，所述临时申请通过引用整体并入。根据37C.F.R.§1.57，申请数据表中标识的任何和所有优先权要求或对其任何更正内容由此通过引用并入。

背景技术

技术领域

本公开涉及交互式图形显示，并且特别地涉及多参数测量(诸如通过诸如流式细胞仪的生物颗粒分析仪分析的来自样品的细胞的测量)的改进的动态交互式显示。

背景技术

颗粒分析仪(诸如流式细胞仪和扫描式细胞仪)是使得能够根据光学参数(诸如光散射和荧光)对颗粒进行表征的分析工具。在流式细胞仪中，例如，使流体悬液中的颗粒(诸如分子、分析物结合的珠粒或单个细胞)通过检测区(在该区域中，颗粒被暴露于通常来自一个或多个激光的激发光)，并测量颗粒的光散射和荧光性质。颗粒或其组分通常用荧光染料标记以有助于检测。通过使用光谱不同的荧光染料标记不同颗粒或组分，可以同时检测多种不同的颗粒或组分。在一些实现方式中，在分析仪中包括多个光电检测器，每个光电检测器用于每一个待测量的散射参数，并且每个光电检测器用于每一种待检测的不同染料。获得的数据包括针对每个光散射参数和荧光发射测量的信号。

细胞仪还可包括用于记录测量的数据和分析数据的设备。例如，可使用连接到检测电子设备的计算机来进行数据存储和分析。例如，数据可以表格形式存储，其中每一行对应于一个颗粒的数据，而列对应于每个测量参数。使用标准文件格式(例如“FCS”文件格式)存储流式细胞仪的数据有助于使用单独的程序和/或机器分析数据。使用当前的分析方法，通常将数据显示在二维(2D)绘图中以便于可视化，但可以使用其它方法来使多维数据可视化。

使用流式细胞仪测量的参数通常包括被颗粒沿大致向前的方向散射(称为前向散射(FSC))的激发光，被颗粒沿大致向侧面的方向散射(称为作为侧向散射(SSC))的激发光，以及从一个或多个光谱通道(频率范围)(称为FL1、FL2等)中的荧光分子发射的光，或者由该通道中主要检测到的荧光染料发射的光。可通过散射参数和由用染料标记的抗体标记各种细胞蛋白而产生的荧光发射来鉴定不同的细胞类型。

流式细胞仪和扫描式细胞仪均可从例如BD Biosciences(San Jose,Calif.)购得。流式细胞术描述于例如Landy等(编辑)，Clinical Flow Cytometry,Annals of theNew York Academy of Sciences第677卷(1993)；Bauer等(编辑),Clinical FlowCytometry:Principles and Applications,WilliamsWilkins(1993)；Ormerod(编辑),Flow Cytometry:A Practical Approach,Oxford Univ.Press(1994)；Jaroszeski等(编辑)，Flow Cytometry Protocols,Methods in Molecular Biology第91期,Humana Press(1997)；和Practical Shapiro,Flow Cytometry，第4版，Wiley-Liss(2003)；所有均通过引用并入本文。荧光成像显微术描述于例如Pawley(编辑)，Handbook of BiologicalConfocal Microscopy，第2版，Plenum Press(1989)(通过引用并入本文)。