[发明专利]优化的核酸抗体构建体

权利要求书

1.一种生成编码结构修饰的DNA编码抗体(DMAb)的核酸序列的方法，所述方法包括以下步骤：

a)鉴定第一DMAb的一个或多个CDR区；

b)鉴定第二DMAb的一个或多个CDR区；

c)用第一DMAb的一个或多个CDR区的氨基酸序列替代第二DMAb的一个或多个CDR区的氨基酸序列，以生成结构修饰的DMAb的氨基酸序列；和

d)生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列。

2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：优化所述核酸序列。

3.一种生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列的方法，所述方法包括以下步骤：

a)将第一DMAb的氨基酸序列或氨基酸序列的片段与一个或多个其他DMAb序列的氨基酸序列或氨基酸序列的片段进行序列比对；

b)用一个或多个其他DMAb序列的氨基酸序列的一个或多个氨基酸残基替代所述第一DMAb的氨基酸序列的一个或多个氨基酸残基，以生成结构修饰的DMAb的氨基酸序列，其中，所述一个或多个氨基酸残基不是CDR区的残基；和

d)生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列。

4.根据权利要求3所述的方法，进一步包括：优化所述核酸序列。

5.一种生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列的方法，所述方法包括以下步骤：

a)鉴定DMAb的氨基酸残基，所述氨基酸残基预测参与可变重链结构域和可变轻链结构域的界面处的相互作用；

b)对鉴定的所述氨基酸残基进行一个或多个氨基酸取代，其中一个或多个取代预测改变所述界面处的等电点和表面电荷的至少之一，从而生成结构修饰的DMAb的氨基酸序列；和

d)生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列。

6.根据权利要求5所述的方法，进一步包括：优化所述核酸序列。

7.一种生成编码结构修饰的DMAb的核酸序列的方法，所述方法包括以下步骤：

a)从DMAb的氨基酸序列中删除CH和CL结构域的氨基酸序列；

b)将VH结构域和VL结构域的氨基酸序列之间的接头的氨基酸序列添加到DMAb的氨基酸序列中以生成结构修饰的DMAb的氨基酸序列；

c)对生成的氨基酸序列进行至少一轮建模；和

d)生成编码结构修饰的DMAb的核苷酸序列。

8.根据权利要求7所述的方法，进一步包括：优化所述核酸序列。

9.根据权利要求7所述的方法，其中所述建模的方法包括接头建模、铰链修饰建模、框架建模和CDR环优化中的至少一种。

10.根据权利要求7所述的方法，其中所述接头与所述VH结构域进行C末端连接，与所述VL结构域进行N末端连接。

11.根据权利要求7所述的方法，其中所述接头与所述VH结构域进行N末端连接，与所述VL结构域进行C末端连接。

12.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，进一步包括以下步骤：

a)从DMAb的氨基酸序列中删除CH和CL结构域的氨基酸序列；

b)将VH结构域和VL结构域的氨基酸序列之间的接头的氨基酸序列添加到DMAb的氨基酸序列中以生成结构修饰的DMAb的氨基酸序列；和

c)对生成的氨基酸序列进行至少一轮建模。

13.一种权利要求1至12中任一项所述的方法的核酸分子所编码的结构修饰的DMAb。

14.一种结构修饰的DMAb，其包括来自第一DMAb的一个或多个CDR区和来自第二DMAb的一个或多个恒定区，其中，与相应的未经如此修饰的DMAb相比，所述结构修饰的DMAb表现出较高的体内表达和较高的结合中的至少一种。