[发明专利]用于黑素瘤检测的方法在审
申请号: | 201880049298.1 | 申请日: | 2018-05-21 |
公开(公告)号: | CN111315897A | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | I.莫林;M.基德;I.德罗斯多夫 | 申请(专利权)人: | 液体活检研究有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 权陆军;黄登高 |
地址: | 圣基茨*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 黑素瘤 检测 方法 | ||
1.用于在需要其的主体中检测黑素瘤的方法,包括:
通过使来自所述主体的测试样品与多种对于检测至少29种生物标志的表达特异性的试剂接触,确定来自所述测试样品的所述至少29种生物标志的表达水平,其中所述至少29种生物标志包括ATL1、ATP6V0D、C1ORF21、CFLAR、CFLAR-AS1、CHP1、DDX55、DMD、DNAJC9、ENOSF1、FANCL、HJURP、HLA-DOA、HLA-DRA、HNRNPA3P1、IL23A、IQGAP1、LOC494127、LOC646471、LOH12CR、PBXIP1、RNF5、SERTAD2、SLC35G5、SPATS2L、TDRD7、TXK、YY2和至少一种持家基因;
使ATL1、ATP6V0D、C1ORF21、CFLAR、CFLAR-AS1、CHP1、DDX55、DMD、DNAJC9、ENOSF1、FANCL、HJURP、HLA-DOA、HLA-DRA、HNRNPA3P1、IL23A、IQGAP1、LOC494127、LOC646471、LOH12CR、PBXIP1、RNF5、SERTAD2、SLC35G5、SPATS2L、TDRD7、TXK和YY2的每一种的表达水平相对于所述至少一种持家基因的表达水平归一化,从而获得ATL1、ATP6V0D、C1ORF21、CFLAR、CFLAR-AS1、CHP1、DDX55、DMD、DNAJC9、ENOSF1、FANCL、HJURP、HLA-DOA、HLA-DRA、HNRNPA3P1、IL23A、IQGAP1、LOC494127、LOC646471、LOH12CR、PBXIP1、RNF5、SERTAD2、SLC35G5、SPATS2L、TDRD7、TXK和YY2的每一种的归一化的表达水平;
将每种归一化的表达水平输入到算法中以产生分数;
将所述分数与第一预定截止值进行比较;和
产生报告,其中当所述分数等于或大于所述第一预定截止值时,所述报告在所述主体中鉴定存在黑素瘤,或者当所述分数低于所述第一预定截止值时,所述报告在在所述主体中鉴定不存在黑素瘤,其中所述第一预定截止值在0至100的等级范围内为20。
2.权利要求1的方法,其中所述至少一种持家基因选自ALG9、SEPN、YWHAQ、VPS37A、PRRC2B、DOPEY2、NDUFB11、ND4、MRPL19、PSMC4、SF3A1、PUM1、ACTB、GAPD、GUSB、RPLP0、TFRC、MORF4L1、18S、PPIA、PGK1、RPL13A、B2M、YWHAZ、SDHA、HPRT1、TOX4和TPT1。
3.权利要求2的方法,其中所述至少一种持家基因包括TOX4和TPT1。
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