[发明专利]诊断慢性阻塞性肺疾病的炎性表型的方法在审
申请号: | 201880052278.X | 申请日: | 2018-06-26 |
公开(公告)号: | CN111356773A | 公开(公告)日: | 2020-06-30 |
发明(设计)人: | P·G·吉布森;K·J·拜尼斯 | 申请(专利权)人: | 纽卡斯尔大学;亨特新英格兰地方卫生区 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 张小勇 |
地址: | 澳大利亚*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诊断 慢性 阻塞 疾病 表型 方法 | ||
1.一种确定患有慢性阻塞性肺疾病(COPD)的受试者的COPD炎性表型的方法,所述方法包括:
确定来自受试者的生物样品中一种或多种基因的表达水平,其中所述一种或多种基因选自CLC、CPA3、DNASE1L3、IL1B、ALPL和CXCR2;
其中所述一种或多种基因的表达水平指示受试者的COPD炎性表型。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述一种或多种基因的表达与COPD炎性表型之间的相关性是通过对mRNA或蛋白质表达水平的统计分析来确定的。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述统计分析包括逻辑回归分析。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中将所述一种或多种基因的表达水平与一种或多种参考样品中相同基因的表达水平进行比较。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述一种或多种参考样品来自已知患有COPD的一个或多个个体。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中与来自已知患有COPD的一个或多个个体的一种或多种参考样品相比,所述生物样品中的CLC、CPA3和/或DNASE1L3中的一种或多种的表达升高指示嗜酸性粒细胞性COPD。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述一种或多种参考样品来自已知没有患有嗜酸性粒细胞性COPD的一个或多个个体。
8.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中与来自已知患有COPD的一个或多个个体的一种或多种参考样品相比,所述生物样品中IL1B、ALPL和/或CXCR2中的一种或多种的表达升高指示嗜中性粒细胞性COPD。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述一种或多种参考样品来自已知没有患有嗜中性粒细胞性COPD的一个或多个个体。
10.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中与来自已知患有COPD的一个或多个个体的一种或多种参考样品相比,所述生物样品中IL1B的表达升高指示非嗜酸性粒细胞性COPD。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述一种或多种参考样品来自已知患有嗜酸性粒细胞性COPD的一个或多个个体。
12.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中将所述生物样品中CLC、CPA3、DNASE1L3、IL1B、ALPL和CXCR2的组合表达谱与来自已知患有COPD的一个或多个个体的一种或多种参考样品中所述基因的组合表达谱进行比较。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述一种或多种参考样品所源自的所述一个或多个个体的COPD炎性表型是已知的。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法,其中所述生物样品是痰。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述痰是诱导痰。
16.一种确定患有COPD的受试者的COPD炎性表型的方法,所述方法包括:
确定来自受试者的生物样品中的基因CLC、CPA3、DNASE1L3、IL1B、ALPL和CXCR2的表达谱;
其中所述基因的表达谱指示受试者的COPD炎性表型。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述基因的表达谱与COPD炎性表型之间的相关性是通过对mRNA或蛋白质表达水平的统计分析来确定的。
18.根据权利要求17所述的方法,其中所述统计分析包括逻辑回归分析。
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