[发明专利]细菌检测方法

说明书

一种检测生物样品中的细菌，以确定生物样品是否包含结核分枝杆菌(MTC)或非结核分枝杆菌(MOTT)的方法，所述结核分枝杆菌(MTC)通利用神经网络的算法，分析由复数个光散射测量组成的测量集合而得到检测。

技术领域

本发明涉及一种细菌检测方法，特别是用于在实验室中分析生物样品的细菌检测方法。

更具体地，本发明涉及特别适合于检测结核细菌或引起结核性疾病的细菌的检测方法。

背景技术

众所周知，结核病(TB)是当今世界上死亡率最高的疾病之一。2013年，有900万人患有TB，其中有150万人死于这种疾病，其中360,000人也是HIV阳性。

TB的威胁在2000年至2013年间缓慢下降；据估计，得益于早期诊断和特效治疗，挽救了3700万人的生命。

TB存在于所有大洲，尽管每年的80％的TB病例记录在相对少数的国家中。

在2013年的900万TB患者中，有56％居住在东南亚和太平洋西部地区(请参见图1中的图表，该图表通过较深的灰色阴影示出了受疾病影响最深的地区)。

另外25％来自非洲。迄今为止，非洲仍然是病例和死亡率最高的地区。仅印度和中国就分别占病例总数的24％和11％。

已知结核是通过分枝杆菌(mycobacteria)传播的，该分枝杆菌称为结核分枝杆菌(Mycobacterium Tubercolosis复合体(complex)MTC)，能够通过空气感染人类。

还已知只有结核分枝杆菌才是结核病的原因，因此，来自分枝杆菌的简单传染并不一定意味着该疾病的传播。

与MTC相比，非结核分枝杆菌(MOTT：除结核分枝杆菌以外的分枝杆菌)具有不同的复制时间和形态。

MTC的发病机理与脐带因子的产生有关。脐带因子是在结核分枝杆菌细胞壁中发现的一种分子，在液体培养物中,其为MTC提供了独特的蛇状外观。

通常可以通过使用抗生素药物来清除分枝杆菌。但是，随着时间的流逝，结核分枝杆菌已对某些抗生素产生了高度耐药性(称为耐多药分枝杆菌，MDR)。因此，在这些情况下，首先必须确定感染了人类的分枝杆菌是否能够抵抗药物，如果能的话，哪些药物。

世界卫生组织(WHO)强调需要找到一种快速、清楚地检测这些分枝杆菌的方法，尤其是请参阅《终结结核病策略：2015年后结核病预防、治疗和控制全球战略和目标(2014)》。

目前，识别分枝杆菌的技术通常涉及很长的培养时间(从液体培养基的至少42天到Lowenstein Jensen培养基测试的90天)以及确认和抗生素敏感性测试。

这些培养时间使已知技术在能源和经济方面均缓慢且昂贵。

该方法的一个缺点在于为了进行确认和抗生素敏感性测试，实验室必须处理样品，从而使分枝杆菌暴露于外部环境；因此它们必须满足许多高安全性要求。

因此，实验室需要经验丰富且合格的人员；难以在世界上最弱势的地区找到这些人员：迄今为止，2013年通报的490万例病例中，只有280万例在细菌学上得到诊断(来自玻片、培养或PCR测试)，而其余的42％仅在临床上得到诊断。

已知方法的另一个缺点是确认和抗生素敏感性测试所需的时间很长，这不允许在短时间内施用任何合适的抗生素。

因此，申请人已经将克服已知方法的缺点的目标设定为研发一种细菌检测方法，该方法特别侧重于识别引起结核病或类似疾病发作的分枝杆菌。

因此，本发明的目的是研发一种改进的方法，以快速检测生物样品内部的结核分枝杆菌的存在，并将其与MOTT细菌菌种区分开。