[发明专利]用于针对所需的且可遗传的性状来挑选反刍动物的方法

说明书

本发明公开一种用于挑选一反刍动物的方法，所述反刍动物具有一所需的且可遗传的性状。所述方法包含：分析在所述动物的一微生物组中的一可遗传的微生物的数量，所述可遗传的微生物与所述可遗传的性状有关，其中所述可遗传的微生物的所述数量指示出所述动物是否具有一所需的且可遗传的性状。

技术领域及背景技术

在本发明的一些实施例中，本发明关于一种基于在一反刍动物的一微生物组中的特定细菌的存在，以针对一所需的且可遗传的性状来挑选所述反刍动物的方法。

牛只的瘤胃微生物组实质上使宿主反刍动物能够通过降解及发酵来消化其饲料。在此意义上，此关系为独特的，并且不同于在人类与非食草动物所演化出的宿主-微生物组的相互作用，在这种情况下不存在这种依赖性。建立于大约五千万年前的这种严格且强制性的宿主-微生物组关系被认为在宿主生理学中扮演一重要的角色。尽管它非常的重要，但对于在所述宿主中的自然遗传变异-通过有性繁殖及减数分裂所引起-对瘤胃微生物组的多个组成与多个宿主的生理性状之间的复杂关系的影响理解甚少。已经知道的是，所述瘤胃微生物组的多个特定的组成与动物生理之间存在有多个关联，主要是通过所述动物从饲料中获取能量的能力来进行例示[Kruger Ben Shabat S等人,2016.ISME J 10:2958-2972]。

这些近期的发现将所述牛只的瘤胃微生物组定位成为努力提高奶牛的饲料效率的全新领域。随着人口不断地增加，这可能对食物安全的多个议题具有多个重要的意涵，例如，针对补充可供人类消耗的多个食物来源，并同时在全球范围内降低环境冲击的努力。尽管它非常的重要，但对于瘤胃微生物组的多个组成与宿主的遗传及生理之间的复杂关系理解甚少。

背景技术包括Guan LL等人,2008.FEMS Microbiology Letters 288:85-9；RoeheR等人,2016.PLoS Genet 12:e1005846；Li Z等人.,2016.Microbiology Reports 8:1016-102；及WO2017/187433。

发明内容

根据本发明的一方面，提供了一种用于挑选一反刍动物的方法，所述反刍动物具有一所需的且可遗传的性状，所述方法包含：分析在所述动物的一微生物组中的一可遗传的微生物的数量，所述可遗传的微生物与所述可遗传的性状有关，其中所述可遗传的微生物的所述数量指示出所述动物是否具有一所需的且可遗传的性状。

根据本发明的一方面，提供了一种用于繁殖一反刍动物的方法，所述方法包含：利用来自于一雄性的反刍动物的精液使一雌性的反刍动物受精，所述雄性的反刍动物已经本文所描述的多个方法被挑选出，从而繁殖出所述反刍动物。

根据本发明的一方面，提供了一种用于增加多个反刍动物的数量的方法，所述多个反刍动物具有一所需的微生物组，所述方法包含：繁殖出所述多个反刍动物的一雄性及一雌性，其中所述雄性的反刍动物及/或所述雌性的反刍动物的任一个的所述瘤胃微生物组包含高于一预定水平的一可遗传的微生物，从而增加具有一所需的微生物组的所述多个反刍动物的数量。

根据本发明的一方面，提供了一种用于确定多个反刍动物的繁殖纯度的方法，所述方法包含：分析所述多个反刍动物的一微生物组，其中在所述微生物组中的一细菌的数量的一相似性指示出所述繁殖纯度。

根据本发明的一方面，提供了一种用于繁殖一反刍动物的方法，所述方法包含：利用来自于一雄性的反刍动物的精液使一雌性的反刍动物受精，所述雌性的反刍动物已经根据本文所描述的多个方法被挑选出，从而繁殖出所述反刍动物。

根据本发明的一些实施例，所述可遗传的微生物包含一种可遗传的细菌。

根据本发明的一些实施例，所述可遗传的细菌为表1所列举的多个操作分类单元(OTU)中的至少一种。

根据本发明的一些实施例，所述可遗传的细菌为拟杆菌门及厚壁菌门，其中所述数量指示出所述动物是否具有一所需的且可遗传的性状。