[发明专利]通过细菌宏基因组分析来诊断淋巴瘤的方法

权利要求书

1.一种提供用于诊断淋巴瘤的信息的方法，该方法包括：

(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA；

(b)使用包含SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及

(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：

来源于选自由蓝细菌门(Cyanobacteria)、栖热菌门(Thermi)和广古菌门(Euryarchaeota)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：

来源于选自由恐球菌纲(Deinococci)、叶绿体纲(Chloroplast)和β-变形菌纲(Betaproteobacteria)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

4.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：

来源于选自由异常球菌目(Deinococcales)、立克次体目(Rickettsiales)、木霉菌目(Streptophyta)、根瘤菌目(Rhizobiales)、海洋螺菌目(Oceanospirillales)、巴氏杆菌目(Pasteurellales)和奈氏球菌目(Neisseriales)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

5.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：

来源于选自由赤杆菌科(Erythrobacteraceae)、红螺菌科(Rhodospirillaceae)、异常球菌科(Deinococcaceae)、类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、线粒体科(mitochondria)、乳杆菌科(Lactobacillaceae)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae)、盐单胞菌科(Halomonadaceae)、微球菌科(Micrococcaceae)、棒状杆菌科(Corynebacteriaceae)、丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、伯克氏菌科(Burkholderiaceae)、放线菌科(Actinomycetaceae)、泰氏菌科(Tissierellaceae)、巴氏杆菌科(Pasteurellaceae)、肉杆菌科(Carnobacteriaceae)、奈瑟菌科(Neisseriaceae)和食烷菌科(Alcanivoracaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。