[发明专利]解析装置、解析方法程序以及非易失性存储介质

说明书

一种解析方法为谋求已知通路和反应量数据的一致性的步骤，其具备：步骤(S12)，将已知通路分解为由彼此连接的2个节点构成的多个子图；步骤(S13)，结合基于各节点间的偏相关系数而求出的独立性检验的概率值，求出表示已知通路的独立性的联合概率值；步骤(S14)，生成具有与已知通路相同数目的节点的多个图表；步骤(S15)，通过与步骤(S12、S13)相同的方法，求出多个图表的联合概率值，生成该多个图表的联合概率值的概率分布；以及步骤(S16)，在由步骤(S15)所获得的概率分布中，求得由步骤(S13)所求得的联合概率值在上侧的概率密度作为图表一致性概率。

技术领域

本发明涉及一种对检体所包含的多个物质进行规定处理时的、反应量数据和已知通路的一致性进行解析的技术。

背景技术

蛋白质的磷酸化通过被激酶所催化的反应来调节细胞增殖、转录控制、细胞死亡、代谢等各种生命机能。已知以癌症为首的疾病等也由于磷酸化酶的异常而引起的，磷酸化信号通路对人的疾病有很大的影响。认为通过解析磷酸化信号通路能够得到有益于药物发现和疾病的诊断等的信息(非专利文献1)。

非专利文献1公开了一种利用肽阵列的磷酸化信号的解析方法。在该文献中，通过比较正常细胞的磷酸化图谱和检体细胞的磷酸化谱图，从而用于疾病的早期诊断(非专利文献1，9页右栏～100页左栏)。

现有技术文献

非专利文献

非专利文献1：船津贵洋他“用于细胞内磷酸化信号网络解析的肽固定化氧化钛基板的开发”北九州工业高等专门学校研究报告第44号(2011年1月)

非专利文献2：堀本胜久他“Network evaluation from consistency of thegraph structure with the measured data”BMC Systems Biology 2008,2:84(2008年10月1日)

发明内容

非专利文献1所记载的方仅停留于能够发现在正常细胞和检体细胞中磷酸化的程度不同的肽，而不能解析其磷酸化信号通路。

本发明者在非专利文献2中，发表了评价测定数据和网络结构的一致性的方法。非专利文献2所公开的方法是网络结构为有向非循环图(DAG)的情况下的方法。并不存在公开评价无向图(非DAG)的网络结构和测定数据的一致性的方法的文献。

本发明鉴于上述背景，其目的在于提供一种解析检体所包含的多个物质的反应量数据和已知通路的一致性的方法。

本发明的解析方法，其用于通过解析装置解析对检体所包含的多个物质进行规定处理时的、反应量数据和已知通路的一致性，且具备如下步骤：

步骤(a)，所述解析装置获取多个关于检体的所述反应量数据；

步骤(b)，所述解析装置从存储有以所述物质作为节点的已知通路的数据的存储部，读取所述已知通路的数据，谋求所述已知通路和所述反应量数据的一致性，并在所述已知通路为无向图的情况下，通过如下步骤谋求与已知通路的一致性：

步骤(b-1)，将所述已知通路分解为由彼此连接的2个节点构成的多个子图；

步骤(b-2)，将所述反应量数据应用于各子图，求得各节点间的偏相关系数，结合所求得的偏相关系数的独立性检验的概率值，求得联合概率值，该联合概率值表示所述已知通路的相对于所述反应量数据的独立性；

步骤(b-3)，生成具有与所述已知通路相同数目的节点的多个图表；

步骤(b-4)，通过与上述步骤(b-1)和(b-2)相同的方法，求得所述多个图表的联合概率，生成所述多个图表的联合概率值的概率分布；