[发明专利]用于诊断癌症的甲基化标志物

权利要求书

1.一种检测疑似患有癌症的受试者中的生物标志物的集合的甲基化模式的方法，所述方法包括：

a)用脱氨基剂处理经提取的基因组DNA以产生包含脱氨基的核苷酸的基因组DNA样品，其中所述经提取的基因组DNA从来自疑似患有癌症的所述受试者的生物样品获得；和

b)通过使所述经提取的基因组DNA与探针的集合接触，检测来自所述经提取的基因组DNA的选自表1、表2、表7、表8、表13、表14或表20的一种或更多种生物标志物的甲基化模式，其中所述探针的集合与所述一种或更多种生物标志物杂交，并且进行DNA测序分析以确定所述一种或更多种生物标志物的甲基化模式。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述检测包括基于探针的实时定量PCR或基于探针的数字PCR。

3.如权利要求2所述的方法，其中所述基于探针的数字PCR是数字液滴PCR。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述探针的集合包括锁式探针的集合。

5.如权利要求1所述的方法，其中步骤b)包括检测选自表2、表13、表14或表20的一种或更多种生物标志物的甲基化模式。

6.如权利要求1所述的方法，其中步骤b)包括检测选自以下的一种或更多种生物标志物的甲基化模式：cg19516279，cg06100368，cg25945732，cg19155007，cg17952661，cg04072843，cg01250961，cg08131100，cg03788131，cg17528648，cg07784526，cg18948743，cg23986470，cg00846300，cg01029638，cg08350814，cg05098590，cg18085998，cg06532037，cg15313226，cg16232979，cg26149167，cg01237565，cg16561543，cg13771313，cg13771313，cg08169020，cg08169020，cg21153697，cg07326648，cg14309384，cg20923716，cg09095222，cg22220310，cg21950459，cg13332729，cg10802543，cg20707333，cg13169641，cg25352342，cg09921682，cg02504622，cg17373759，cg06547203，cg06826710，cg00902147，cg17609887，cg15721142，cg08116711，cg00736681，cg18834029，cg06969479，cg24630516，cg16901821，cg20349803，cg23610994，cg19313373，cg16508600，cg24096323，cg24746106，cg12288267，cg10430690，cg24408776，cg05630192，cg12028674，cg24820270，cg12028674，cg26718707，cg10349880，cg09921682，cg25934700，cg14164596，cg24461337，cg23041410，cg07366553，cg26859666，cg06405341，cg08557188，cg00690392，cg03421440，cg07077277或cg20702527。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述受试者疑似患有乳腺癌，并且步骤b)包括检测选自以下的一种或更多种生物标志物的甲基化模式：cg19516279、cg06100368、cg20349803、cg23610994、cg19313373、cg16508600或cg24096323。