[发明专利]成像数据处理装置以及成像数据处理程序在审
申请号: | 201880091068.1 | 申请日: | 2018-03-30 |
公开(公告)号: | CN111837031A | 公开(公告)日: | 2020-10-27 |
发明(设计)人: | 池上将弘 | 申请(专利权)人: | 株式会社岛津制作所 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62 |
代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 | 代理人: | 刘新宇 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 成像 数据处理 装置 以及 程序 | ||
在数据处理部中,使一个图像适当变形以使从不同的试样分别得到的MS成像图像上的相同部位的位置和大小一致,由此进行位置对准(S1~S5)。在显示部的画面上显示进行了位置对准后的图像,当用户在成为基准的图像上设定关心区域时(S6),在成为基准的图像和不是基准的图像中分别提取中心点包含在所设定的关心区域的范围内的微小区域(S7)。在进行图像变形后的图像中,各微小区域的形状变形,虽然微小区域没有排列成整齐的网格状,但中心点包含在关心区域的范围内的微小区域视为包含在该关心区域的范围内,由此与图像变形无关地基于与关心区域对应的适当的微小区域中的数据值来进行比较解析。
技术领域
本发明涉及一种成像数据处理装置以及数据处理程序,该成像数据处理装置对通过针对试样上的二维测定区域内的多个微小区域分别实施规定的分析所得到的数据、和通过处理该数据而按每个该微小区域得到的数据进行处理,该数据处理程序用于在计算机上实施该处理。更为详细地说,本发明涉及一种用于在基于测定区域内的每个微小区域的数据制作的图像上设定用户应该特别关注或要重点观察的关心区域(ROI=Region OfInterest)的成像数据处理装置以及成像数据处理程序。
背景技术
质谱分析成像法是如下一种方法:通过针对生物体组织切片等试样上的二维测定区域内的多个微小区域(测定点)分别进行质谱分析,来研究具有特定质量的物质的空间分布,该质谱分析成像法正在不断地应用于新药研发、生物标记搜索、各种疾病/疾患的原因探明等。用于实施质谱分析成像的质谱分析装置一般被称为成像质谱分析装置(参照非专利文献1、2等)。
在成像质谱分析装置中,一般针对试样上的多个微小区域分别获得遍及规定的质荷比(m/z)范围的质谱数据(包括n为2以上的MSn谱数据)。当用户指定源自想要观察的化合物的离子的m/z值时,成像质谱分析装置的数据处理部在各微小区域中提取与该指定的m/z值对应的信号强度值。然后,按照灰阶或色标使该信号强度值可视化,从而制作与微小区域的位置对应的二维图像(质谱分析成像图像,以下称为“MS成像图像”)并显示在显示部的画面上。
近年来,正在盛行以下研究:通过使用这样的成像质谱分析装置对从生物体组织切取的试样进行观察,来研究生物体中的各种脏器或器官内的化合物的分布差异、和/或病理部位与健康部位的化合物的分布差异等。在进行这样的测定和解析时,经常希望在多个试样之间将特定化合物的分布进行比较。例如,在医药品的研究和开发的现场经常存在以下情况:将从老鼠等实验动物的脏器切取的切片作为试样,希望针对药物的有无投放、投放的药物的种类及量的差异、药物投放后的经过时间等来比较在该脏器中的特定部位产生的病变组织的状态的变化。在这样的情况下,如果将与从药物投放条件不同的老鼠采集的同一脏器的特定化合物对应的MS成像图像进行比较,则仅通过光学显微观察就能够掌握未知的病变组织的变化。
另外,最近还进行了以下尝试:对从老鼠的脏器连续地以切片状切取的多个切片试样(以下称为“连续切片试样”)分别实施成像质谱分析,并将各切片试样的二维的MS成像图像进行层叠,由此制作三维的MS成像图像(参照非专利文献3等)。
在如上所述那样将针对从不同实验动物的同一脏器的同一部位分别采集的试样获取到的质谱分析成像数据进行比较的情况下,即使是同一脏器的同一部位,也存在个体差异,因此无法避免应该比较的部位的形状和大小存在某种程度的差异。另外,即使是从相同个体的同一脏器切取的连续切片试样,测定对象部位的形状和大小也并非完全相同,通常存在某种程度的差异。因此,在进行源自多个试样的质谱分析成像数据的比较解析、将源自连续切片试样的质谱分析成像数据层叠的处理时,需要以使相同部位的位置、大小、形状等尽可能一致的方式进行MS成像图像的位置对准。
以往,一般来说,操作者一边在显示画面上确认作为位置对准对象的多个MS成像图像,一边通过以手动作业方式进行移动、旋转、放大/缩小、非线性变形等图像变形处理来进行位置对准。然而,这样的作业费时费工,效率低。另外,MS成像图像原本表示源自具有某质量的化合物的离子的强度分布、即存在量的分布,未必示出某部位或组织构造的轮廓、边界,因此难以在MS成像图像之间进行准确的位置对准。
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