[发明专利]诊断血液测试

说明书

本申请提供了一种用于测定受试者中细胞外基质(ECM)降解的体外方法，该方法包括测定从受试者分离的样品中选自由胶原V型α1链(COL5A1)、转化生长因子β‑1(TGFB1)、整合素亚基α4(ITGA4)、整合素亚基β1(ITGB1)、基质金属肽酶2(MMP2)、基质金属肽酶9(MMP9)和骨形态发生蛋白1(BMP1)组成的组中至少一种基因的表达产物水平，所述至少一种基因任选地与胶原XI型α1链(COL11A1)和胶原V型α2链(COL5A2)中的一者或两者组合测定，其中，当所述表达产物水平高于参考值时，这表明降解的ECM。还提供了用于诊断和预后癌症和动脉瘤的方法。此外，还提供了用于在上述诊断或预后方法中测定基因表达产物水平的试剂以及含有所述试剂的试剂盒。

技术领域

本发明涉及诊断领域，特别是血液样品的诊断，更特别地用于通过检测细胞外基质的降解来诊断和预后癌症和动脉瘤。

背景技术

癌症代表常见的和日益增加的死亡原因。世界卫生组织估计，在接下来的20到30年期间，癌症将是世界范围内主要的死亡原因。对抗癌症死亡率增加的最有效的武器是早期诊断。如果在其早期阶段检测到，许多类型的癌症可以被有效地治疗。这种现实强调了需要开发一套简单、可靠和成本有效的分子标记物以用于检测癌发生初始阶段的癌症。有效对抗癌症的另一个重要策略是早期鉴定处于发生转移风险的患者，以便更频繁地对其进行随访，以及在该患者亚组中应用更积极的治疗干预。

最近的进展还突出了局部微环境或生态位的非细胞组分(特别是细胞外基质(ECM))在癌症进展期间的重要性。ECM是由支持细胞分泌的细胞外分子的混合物，其为周围细胞提供结构和生化支持。哺乳动物的ECM包括间隙基质和基底膜。间隙基质存在于各种哺乳动物细胞之间(即，在细胞间空间中)。多糖和纤维状蛋白的凝胶填充间隙空间，并用作压缩缓冲液对抗ECM上施加的拉伸应力。基底膜是ECM的片状沉积物，各种上皮细胞靠在其上。哺乳动物中的每种类型的结缔组织具有一种类型的ECM：胶原纤维和骨矿物质包含骨组织的ECM；网状纤维和基质包含疏松结缔组织的ECM；且血浆是血液的ECM。

尽管长期以来认为是在维持组织形态中起主要支持作用的稳定结构，ECM是驻留细胞环境的重要部分，其令人惊讶地是动态的和通用的，并且影响细胞生物学的基本方面。细胞粘附、细胞间通信和分化是ECM的常见功能。ECM功能的这种多效性方面取决于ECM的高度动态结构及其作为有效机制的重塑，由此可调节多种细胞行为。ECM生物学中的主要挑战是了解ECM在正常发育中的作用以及ECM动力学的破坏可如何导致疾病(如癌症)。

可能受ECM改变而高度影响的疾病的另一个示例是主动脉瘤。在主动脉瘤中，主动脉壁的ECM降解最初导致主动脉扩张，然后导致动脉瘤形成。

主动脉瘤代表重要的临床实体，其无症状地发展直到发生破裂或剥离。它是发达国家中重要的导致死亡的原因。主动脉瘤的破裂通常是第一症状，同时也是最后的症状，伴有死亡率为75％。据估计，由于普通人口的老龄化，在未来几年主动脉瘤的发病率将在世界范围内持续增加。导致动脉瘤形成的发病机理和分子机制正在研究中，并且目前还没有能够可靠地检测主动脉瘤的简单实验室测试。

鉴于上述流行病学数据，迫切需要提供用于癌症和主动脉瘤的早期诊断的简单且可靠的测试，以及用于有效随访患者以便早期鉴定处于发生转移或复发风险的患者的方法。此外，通常需要更好的策略来优化癌症和动脉瘤患者的治疗方案。

具体实施方式

本发明人惊讶地发现，通过测定外周血中某些基因的表达水平可准确地检测ECM的异常功能或降解。外周血中这些特定基因组的过表达揭示了促进ECM重塑的分子机制的活化水平，这与癌症和动脉瘤进展有关。

检测ECM降解或异常功能的指纹图包含表1所示基因。

表1.用于测定ECM降解的遗传指纹图。