[发明专利]一种用于检测苯丙酮尿症相关致病基因的试剂盒及其专用捕获探针组

说明书

本发明公开了一种用于检测苯丙酮尿症相关致病基因的试剂盒及其专用捕获探针组。本发明提供的捕获探针由序列表中序列1至序列108所示的探针组成。本发明的试剂盒能同时检测PAH、PTS、GCH1、QDPR、PCBD1、SPR这6个苯丙酮尿症的致病基因，对于多种点突变类型的苯丙酮尿症均可检测，且可检测PAH、PTS、GCH1、QDPR、PCBD1、SPR基因的全长，有利于新的致病突变的发现，为苯丙酮尿症的遗传学基础提供新的发现手段。

技术领域

本发明属于基因工程、分子遗传学及基因检测领域，具体涉及一种用于检测苯丙酮尿症相关致病基因的试剂盒及其专用捕获探针组。

背景技术

苯丙酮尿症(PKU)是一种常见的氨基酸代谢病，是由于苯丙氨酸(PA)代谢途径中的酶缺陷，使得苯丙氨酸不能转变成为酪氨酸，导致苯丙氨酸及其酮酸蓄积，并从尿中大量排出。本病在遗传性氨基酸代谢缺陷疾病中比较常见，其遗传方式为常染色体隐性遗传。临床表现不均一，主要临床特征为智力低下、精神神经症状、湿疹、皮肤抓痕征及色素脱失和鼠气味等、脑电图异常。如果能得到早期诊断和早期治疗，则前述临床表现可不发生，智力正常，脑电图异常也可得到恢复。研究表明苯丙酮尿症的主要致病基因有PAH、PTS、GCH1、QDPR、PCBD1、SPR。PKU分为两种类型：经典的PKU和BH4缺乏性PKU，其中经典PKU占99％，是由于染色体基因突变导致肝脏中PAH缺陷而引起的苯丙氨酸代谢障碍所致。BH4缺乏性PKU是四氢生物蝶呤合成或代谢途径中某种酶的先天性缺陷导致一些芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸及精氨酸)代谢障碍，影响脑内神经递质合成，从而导致严重的神经系统损害症状体征和智能障碍。包括较常见的6-丙酮酰四氢蝶呤合成酶缺乏症(PTPS)、二氢蝶啶还原酶缺乏症(DHPR)、尿苷三磷酸环水解酶缺乏症(GTPCH)、蝶呤-4α-二甲醇氨脱水酶缺乏症(PCD)及墨蝶呤还原酶缺乏症(SR)，分别由PTS、QDPR、GCH1、PCBD1及SPR基因突变致病。

PKU发病率有种族和地区差异，白人发病率较高，黑人和黄种人较低。发病率在欧洲约为1/10000，德国约为1/7000，爱尔兰约为1/4400，日本约为1/120000，我国的发病率约为1/11188，其中北方地区发病高于南方，并且西北地区发病率明显高于国内平均水平，这可能与西北地区独特的地理位置构成有关。而且当地的PKU筛查覆盖率和治疗率均落后于发达城市，大部分患儿得不到及时的治疗，严重影响了人口的素质，增加了婴儿的死亡率，而且给家庭和社会带来了巨大的损失。因此PKU的早期诊断、早期治疗，有效预防患儿的出生，对于控制PKU发生和发展显得尤为重要。

目前苯丙酮尿症常规的临床诊断方法主要有血苯丙氨酸测定、尿液蝶呤谱分析、血红细胞二氢生物喋啶还原酶活性测定、头颅核磁共振检查等，这些传统的方法不仅不能对患者进行早期诊断，而且对于明确鉴别杂合子和正常个体有一定的困难。由于苯丙酮尿症的致病基因都在肝脏和肾脏中表达，基因诊断成为早期诊断的最有效手段，市场上已经有的检测方法有：单连多态性PCR检测、等位基因特异性扩增、短串联重复序列及高压液相色谱定量等，这也为PKU的早期诊断提供检验科学依据和基础。

发明内容

本发明的一个目的是提供一种用于捕获苯丙酮尿症相关基因的探针组。

本发明提供的用于捕获苯丙酮尿症相关基因的探针组由序列表中序列1至序列108所示的探针组成。

上述探针组中，所述每条探针均标记生物素，具体的，所述每条探针的5’端均标记生物素。