[发明专利]一种空间转录组检测芯片及方法

权利要求书

1.一种空间转录组的检测芯片, 其特征在于：包括微孔板以及编码测序微球，微孔板上设有编码测序微球。

2.如权利要求1所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述编码测序微球为微球本体与寡核苷酸链进行偶联反应生成。

3.如权利要求2所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述寡核苷酸链为微球本体与多聚U尾进行偶联反应生成。

4.如权利要求1所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于，所述微孔板的制备方法，具体步骤如下：

（1）在硅片上蚀刻微孔作为初始模具，微孔直径在10~200 μm;

（2）在初始模具上浇注聚二甲基硅氧烷，成型后取下，即可制成带有微柱的反向模具；

（3）在反向模具上浇注加热融化的琼脂糖，冷却成型后取下，即可制成微孔板。

5.如权利要求1所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述微孔板上设有微孔，编码测序微球投入至微孔内；所述微孔为圆形、六边形或者方形，所述微孔的排列方式为有规则排列或者无规则排列。

6.如权利要求5所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述微孔的间距为1-100μm。

7.如权利要求5所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述微孔的数目为1个及以上。

8.如权利要求3所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述微球本体的直径为10-35 μm。

9.如权利要求3所述的一种空间转录组的检测芯片，其特征在于：所述微球本体为硅胶微球、玻璃微球、磁性微球、交联葡聚糖琼脂糖凝胶微球、二氧化硅微球、纤维素微球、聚苯乙烯微球或聚丙烯微球中任意一种或以上的组合。

10.一种用于如权利要求1-9所述一种空间转录组的检测芯片的检测方法，其特征在于，所述具体步骤为：

（1）编码测序微球的制备：将编码测序微球加入到微孔板中，对微孔板中的编码测序微球进行测序，并记录编码测序微球在微孔板中编号，或将已知编码序列的编码测序微球按照序列加入微孔中，并记录微球在微孔板中的位置信息；

（2）组织切片；

（3）组织固定；

（4）渗透处理；

（5）cDNA合成：将组织盖印在装有放置编码序列微球的微孔板芯片上，捕获组织细胞中mRNA，进行反转录，合成cDNA；

（6）组织移除；

（7）微球释放；

（8）测序文库建设、测序、数据处理及分析：收集带有编码测序微球的单细胞，构建测序文库，进行组织细胞序列及空间位置信息检测。