[发明专利]橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针有效
申请号: | 201910018051.X | 申请日: | 2019-01-09 |
公开(公告)号: | CN109468392B | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 朱雅君;侯淑玲;刘静远;田沂民;于翠 | 申请(专利权)人: | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/686 |
代理公司: | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人: | 王函 |
地址: | 200125 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 橘臀纹粉蚧 实时 荧光 pcr 检测 方法 引物 探针 | ||
本发明公开了一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针,根据橘臀纹粉蚧的mtDNA中部分基因的序列设计特异性引物PCF3/PCR3和探针PC‑MGB,建立了橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,以达到快速准确检测鉴定橘臀纹粉蚧,并用于准确区分橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧的目的。
技术领域
本发明涉及农林业和植物检疫技术领域,具体涉及一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法;此外,本发明还涉及检测橘臀纹粉蚧的引物和探针。
背景技术
橘臀纹粉蚧Planococcus citris(Risso)又名橘粉蚧、柑橘臀纹粉蚧,隶属于同翅目(Homoptera)粉蚧科(Pseudococcidae)臀纹粉蚧属(Planococcus),是热带、亚热带观赏性植物、水果的主要害虫,其主要为害寄主植物的茎、叶片、花果等幼嫩部位,轻者叶片变黄,重者干枯脱落,使植株发育不良,严重影响水果的经济价值和观赏性植物的品相。同时,橘臀纹粉蚧与另一种重要的检疫性粉蚧大洋臀纹粉蚧P. minor (Maskell)形态相近,且常在一种寄主上混合发生,极易混淆,区分两者难度较大,因此建立快速准确鉴定橘臀纹粉蚧方法十分必要。
《GB/T 35340-2017 大洋臀纹粉蚧和柑橘臀纹粉蚧检疫鉴定方法》中列出了区分大洋臀纹粉蚧和橘臀纹粉蚧的传统形态学鉴定方法,传统形态学鉴定方法需2—3天,鉴定时间长;传统形态学检测方法需要先制作玻片,观察形态学特征才能鉴定,并且鉴定者需要一定鉴定经验,存在人工误差,影响鉴定准确率。
中国专利申请CN2011100500314公开了南洋臀纹粉蚧的实时荧光PCR引物、探针及检测方法,其检测目标是南洋臀纹粉蚧,与本发明的检测目标橘臀纹粉蚧种类不同,且设计的引物和探针、PCR反应体系和反应条件均不同。南洋臀纹粉蚧与橘臀纹粉蚧在外部形态上有区别,因此容易区分。
本发明橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧不仅在外部形态上近似,两者在分子水平上的差异也较小,这对橘臀纹粉蚧实时荧光特异性Taqman探针的设计造成一定难度,是本领域的技术难题。因此,本领域亟需解决这一技术难题。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法;为此,本发明还提供用于上述方法的检测引物和探针。利用橘臀纹粉蚧检测引物及探针可以快速、准确地对橘臀纹粉蚧进行检测鉴定。
本发明根据橘臀纹粉蚧的mtDNA中部分基因的序列设计特异性引物和探针,建立了橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR 检测方法,以达到快速准确检测鉴定橘臀纹粉蚧的目的。
在本发明的一方面,提供一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,包括如下步骤:
(1) 设计引物和探针;
该引物的序列为:
上游引物PCF3:5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’ , 如SEQ ID NO:6所示序列或其互补链;
下游引物PCR3:5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’ , 如SEQ ID NO:9所示序列或其互补链;
该探针的序列为:
橘臀纹粉蚧探针PC-MGB:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’, 如SEQ ID NO:10所示序列或其互补链;荧光基团连接在探针的5’末端,淬灭基团连接在3’末端;
(2) 提取橘臀纹粉蚧DNA;
(3) 采用步骤(1)设计的引物和探针进行实时荧光PCR检测,用以区分橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧。
作为本发明优选的技术方案,步骤(2)具体为:取橘臀纹粉蚧单头虫样放入研钵,加液氮磨成粉末状,用试剂盒提取样品DNA。
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