[发明专利]一种TaqMan-MGB探针技术检测影响降脂药物疗效基因的方法学建立在审
申请号: | 201910029842.2 | 申请日: | 2019-01-11 |
公开(公告)号: | CN109897896A | 公开(公告)日: | 2019-06-18 |
发明(设计)人: | 刘哲;张陆明;姜柳 | 申请(专利权)人: | 江苏百世诺医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
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地址: | 225300 江苏省泰州市中国医*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 降脂药物 检测 基因 实时荧光定量PCR 待测样本 功能意义 技术联合 临床医生 探针技术 特异性强 治疗效果 个体化 多态性 方法学 假阳性 引物 突变 污染 | ||
1.一种检测影响降脂药物疗效基因突变用的引物、TaqMan/MGB探针,其特征在于,引物探针的序列如下:
1)用于SLCO1B1基因T521C SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-AAAGGAATCTGGGTCATAC-3’,
下游引物:5’-CCTATTCCACGAAGCATA-3’,
野生探针:5’-FAM-CCATGAACACATATA-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-CATGAACGCATATA-MGB-3’;
2)用于SLCO1B1基因A388G SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-TTGATTAATTAAACAAGT-3’,
下游引物:5’-TCAGTGATGTTCTTACAG-3’,
野生探针:5’-FAM-ATGAATTGATATTAG-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-ATGAATCGATATTAG-MGB-3’;
3)用于SLCO1B1基因G910A SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-CTCATATATGCATCCTC-3’,
下游引物:5’-TATATACACACAAACAT-3’,
野生探针:5’-FAM-TGTATACAGGTAAA-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-TGTATACAGGTAAA-MGB-3’;
4)用于ApoE基因T388C SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-CTGTCCAAGGAGCTG-3’,
下游引物:5’-CCGCGCACGTCCT-3’,
野生探针:5’-FAM-CCGCACACGTCCT-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-CCGCGCACGTCCT-MGB-3’;
5)用于ApoE基因C526T SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-CCTCGCCTCCCACC-3’,
下游引物:5’-CCCGGCCTGGTAC-3’,
野生探针:5’-FAM-TGCCAGGCGCTTC-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-TGCCAGGCACTTC-MGB-3’;
6)用于NPC1L1基因C18A SNP位点检测的引物和TaqMan/MGB探针:
上游引物:5’-TCACCAAGCGCAGGAG-3’,
下游引物:5’-CTGCCTTAATGTGTGTTCA-3’,
野生探针:5’-FAM-CGCTGAGCCCTTC-MGB-3’,
突变探针:5’-HEX-CGCTGATCCCTTC-MGB-3’。
2.根据权利要求1所述引物探针,其特征在于5’端标记有报告基团(Reporter,R),如FAM、HEX、VIC或者ROX等,3’端标记的淬灭基团采用非荧光淬灭基团(NFQ),本身不产生荧光,可以大大降低本底信号的强度,同时探针上还连接有MGB修饰集团,引物Tm值比探针Tm值低10℃左右,探针序列两端的标记为5’FAM-3’MGB、5’HEX-3’MGB、5’ROX-3’BHQ2。
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