[发明专利]基于深度学习技术的肺部解剖学位置定位算法在审
申请号: | 201910038444.7 | 申请日: | 2019-01-16 |
公开(公告)号: | CN109886967A | 公开(公告)日: | 2019-06-14 |
发明(设计)人: | 赵继帆 | 申请(专利权)人: | 成都蓝景信息技术有限公司 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06T3/40 |
代理公司: | 成都中亚专利代理有限公司 51126 | 代理人: | 王岗 |
地址: | 610041 四川省成都市武侯区武侯*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 解剖学位置 肺叶 定位算法 分割方式 肺部 分割 肺部CT图像 语义 肺部病变 分割模型 光照影响 几何形变 数据学习 数据增强 网络架构 训练过程 自动分割 不敏感 传统的 多阶段 多输出 肺部CT 能力强 保证 拟合 算法 学习 表现 网络 | ||
本发明公开了一种基于深度学习技术的肺部解剖学位置定位算法,能对肺部CT进行准确快速的划分,本专利提出的算法,能简单、快速、准确的实现基于肺部CT图像的肺叶的自动分割,从而实现肺部病变的解剖学位置定位。相比传统的分割方法,优点突出,具体表现在:(1)过程简单,端到端的分割方式,完全不需要关注其他过程;(2)多阶段多输出的网络架构在不同阶段对网络加以控制,使得分割效果更好,基于语义的分割方式,能很最大程度上保证分割精度;(3)泛化能力强,训练过程的数据增强,保证了模型能对不同的、多样的数据学习,即保证了分割模型的泛化能力,同时也在一定程度上避免了过拟合的风险,在对不同CT进行肺叶划分时,对CT的几何形变和光照影响不敏感。
技术领域
本发明涉及一种肺部解剖学位置定位算法,具体来讲是一种基于深度学习技术的肺部解剖学位置定位算法。
背景技术
肺在临床上分为五个肺叶区域,左肺分为上下两肺叶,右肺分为上中下肺叶,在医学上有重大意义。
目前的肺叶分割算法,主要思想是先提取“肺裂”,再依据肺裂来实现肺叶的区域分割。这类方法典型存在如下不足:
(1)方法过程复杂,这类方法首先要分割出肺主体、气管、血管等,去除这些组织的干扰。再根据计算机图形学,提取出肺裂,最后再利用分割或者聚类算法进行肺叶区域的划分;
(2)计算量大,根据(1)中所描述的过程,需要大量的计算,特别是在分割气管、血管时常常使用区域增长算法,另外,在肺裂提取时需要计算图像的黑塞矩阵,再对该矩阵进行特征值与特征向量的计算,而CT图像信息量,进行如上的计算,无疑是一个极其耗费时间的过程;
(3)分割效果不好,首先,在肺裂提取时,其它类似的图形结构被提取出来,所以往往需要二次提取,即使是这样,提取出的肺裂一样会出现断裂或者被其他组织干扰的问题。除此之外,病变的肺部CT以及非高清CT的会出现肺裂不明显、肺裂残缺甚至肺裂消失,会对肺裂的提取造成极大的困难,这会导致肺叶区域划分时,出现区域不连续或者区域错误。
(4)泛化能力差,分割过程,需要设置种子点、阈值等,这些值的设定和选择会极大程度上影响最后的分割效果。再加之CT图像的个体差异以及几何多样性,使得这些方法很难满足实际需要。
发明内容
因此,为了解决上述不足,本发明在此提供一种基于深度学习技术的肺部解剖学位置定位算法。本专利提出一种端到端的深度学习网络,能对肺部CT进行准确快速的划分,本专利提出的算法,能简单、快速、准确的实现基于肺部CT图像的肺叶的自动分割,从而实现肺部病变的解剖学位置定位。
本发明是这样实现的,构造一种基于深度学习技术的肺部解剖学位置定位算法,其特征在于:过程如下:
(1)对输入CT进行数据类型转换,将图像的像素值从32位浮点数类型转换到无符号8位整型,从而降低算法的内存消耗和提高计算效率;
(2)对转换后的CT和标签图像先进行缩放,将CT图像大小缩小为原始CT的1/2,为了近一半避免训练中出现的内存溢出问题,需要将缩放后的图像进行分块,包括重叠的分块和不重叠的分块,并对块的尺寸进行不同的尝试,发现有无重叠对最后效果并无大的影响,而过小的尺寸会造成训练中丢失全局信息,最后选择为128×128×128为划分大小,原始图像不足该大小的以0填充;
(3)将划分后源数据和标签输入网络训练,标签以1到5分别表示左肺的上下叶和右肺的上中下叶;对图像进入网络训练之前,现将图像按照(2)的缩放和划分,网络的输入尺寸为128×128×128,以UNet为骨干网络,并以多阶段多输出控制网络学习,网络以多阶段的DiceLoss和作为网络的损失函数,采用Adam优化算法,batchsize为4,训练5个epoch后dice系数在验证集上为0.9437。
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