[发明专利]FAT3基因甲基化检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用有效
申请号: | 201910045385.6 | 申请日: | 2019-01-17 |
公开(公告)号: | CN111440865B | 公开(公告)日: | 2023-08-01 |
发明(设计)人: | 禹汇川;骆衍新;白亮亮;唐冠楠;王小琳;黄品助;黄安培;李英杰;黄美近;王磊;汪建平 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第六医院;中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市万慧达律师事务所 11111 | 代理人: | 谢敏楠 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | fat3 基因 甲基化 检测 试剂 制备 直肠癌 预后 诊断 中的 应用 | ||
1.基因检测试剂在制备早期结直肠癌预后诊断试剂或试剂盒中的应用,所述基因为FAT3基因,所述的FAT3基因检测试剂为FAT3基因甲基化检测试剂。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述基因还包含DUSP3基因、TLE4基因、KAZN基因中的一种或多种。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述基因还包括DUSP3基因和TLE4基因的组合。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的FAT3基因检测试剂为检测FAT3基因经转化试剂修饰后的序列的试剂。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的转化试剂选自肼盐、重亚硫酸氢盐和亚硫酸氢盐中的一种或几种。
6.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的转化试剂选自亚硫酸氢盐。
7.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的FAT3基因甲基化检测试剂的检测区域为FAT3基因的CpG open seas或基因体区域。
8.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的FAT3基因甲基化检测试剂的检测区域的序列为SEQ ID NO:1。
9.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的检测试剂含有DNA芯片。
10.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述FAT3基因甲基化的检测中,甲基化程度高,则结直肠癌复发高风险;当甲基化程度低,则结直肠癌复发低风险。
11.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述FAT3基因甲基化程度的阈值取值为46.07%。
12.根据权利要求1-11任一所述的应用,其特征在于,检测样品为肠粘膜组织。
13.一种早期结肠直肠癌预后诊断系统,其特征在于,所述的诊断系统含有:
检测构件:所述的检测构件用以检测诊断对象的FAT3基因甲基化程度;
结果判断构件:所述的结果判断构件用于根据检测构件所检测的FAT3基因甲基化程度的结果,输出甲基化百分比参数PMR或疾病风险结果;所述的检测构件为超微量分光光度计、实时荧光定量PCR仪、超高灵敏度化学发光成像系统中的一种或几种;所述的结果判断构件含有输入模块、分析模块和输出模块;输入模块用于输入FAT3基因甲基化程度;分析模块用于根据FAT3基因甲基化程度,分析出治愈后的结肠直肠癌复发的可能性或者风险值;输出模块用于输出分析模块的分析结果。
14.根据权利要求13所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR为甲基化/(甲基化+非甲基化)×100。
15.根据权利要求13所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR=甲基化荧光值/(甲基化荧光值+非甲基化荧光值)×100。
16.根据权利要求13所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR=100/(1+1/2-ΔCT),ΔCT=CT甲基化荧光–CT非甲基化荧光。
17.根据权利要求13所述的诊断系统,其特征在于,所述FAT3基因甲基化程度为样品中FAT3基因体区域CG位点的甲基化比例。
18.根据权利要求13所述的诊断系统,其特征在于,检测样品为肠粘膜组织。
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