[发明专利]一种与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记及其应用，所述的分子标记位于蛋鸭LRRTM1基因部分编码区序列，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列长度为1427bp，该序列的第1259bp处存在一个T/C的等位基因突变；其单核苷酸多态性(SNP)可以作为蛋鸭产蛋和蛋品质相关性状的分子标记，本发明还公开了该分子标记的筛选方法及其在蛋鸭产蛋和蛋品质相关性状关联分析中的应用。该分子标记在蛋鸭产蛋和蛋品质性状辅助选择中的应用，检测方法快速、准确，且不受养殖环境条件因素影响。

技术领域

本发明涉及蛋鸭分子标记筛选技术领域，尤其涉及与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphsim，SNP)是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A、T、C或G)的突变而引起的多态性，包括单碱基的插入、缺失、转化和颠换等。由于分布的广泛性和稳定性，在动物分子标记辅助选择(Marker Assisted Selection,MAS)育种上发挥着重要作用，成为加快蛋鸭重要经济性状尤其是那些限性性状遗传改良的可行性技术。基于此，进一步鉴定与蛋鸭经济性状相关的分子标记，进而借助MAS将大大提高选种的准确性。

产蛋性能和蛋品质性状是蛋鸭生产中重要的经济性状，主要包括开产日龄、40周龄产蛋数、72周龄产蛋数、蛋壳强度、蛋白高度、蛋黄重、哈氏单位、蛋黄颜色等，是典型的由微效多基因控制的数量性状，同时受环境、营养以及饲养管理等多个因素的影响。利用分子标记辅助选择技术、通过对产蛋性能和蛋品质性状相关基因或与之连锁的分子标记进行选择，寻找蛋鸭产蛋性状基因座相连锁的分子标记，并将其应用于蛋鸭产蛋性能和蛋品质性状的改良，成为加快高产、优质蛋鸭新品种培育的有效手段之一，对于高产、优质蛋鸭品种的培育具有重要意义。

富亮氨酸重复序列跨膜蛋白1(Leucine rich repeat transmembrane neuronal1，LRRTM1)是一种突触细胞粘附蛋白，主要在人大脑皮质表达，其与神经轴蛋白和神经信号蛋白相互作用，调节谷氨酸能神经元的突触细胞粘附。已有研究表明LRRTM1基因对人的精神分裂症(Takashima et al.,2011)、用手习惯(Beste et al.,2018)、小鼠的视觉行为(Aboozar et al.,2018)等具有重要的调控作用。LRRTM1基因在蛋鸭上的研究却鲜有报道，迄今为止，尚无有关蛋鸭LRRTM1基因作为鸭产蛋和蛋品质性状的分子标记的研究。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术之缺陷，提供了与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记及其筛选方法与应用，本发明发掘了与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记，为蛋鸭产蛋和蛋品质性状辅助选择提供参考依据。

本发明的目的之一在于提供一种与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记所述的分子标记位于蛋鸭LRRTM1基因部分编码区序列，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ IDNO：1所示，该序列长度为1427bp，该序列的第1259bp处存在一个T/C的等位基因突变。

所述序列的第1259bp处的T或C的碱基多态性位点，表现为TT、TC或CC三种基因型，其中TC基因型为蛋鸭产蛋和蛋品质性状的优势基因型。

本发明的目的之二在于提供所述的分子标记的引物对，所述引物对为：

上游引物：5'-TTCCTTCTTATCGGTCTC-3'(SEQ ID NO：2所示)，

下游引物：5'-ATGCATGGTCTGTTTCTG-3'(SEQ ID NO：3所示)。

本发明的目的之三在于提供一种筛选与蛋鸭产蛋和蛋品质性状相关的分子标记的方法，包括如下步骤：