[发明专利]一种环状RNA作为胃癌和结直肠癌诊断生物标志物和治疗靶点的应用

说明书

本发明公开了环状RNA FOCAD(circ‑FOCAD)作为一种新的潜在的胃癌和结直肠癌诊断生物标志物和治疗靶点的应用。circ‑FOCAD(hsa_circ_0008678|chr9：20923658‑20933102+|FOCAD)是由FOCAD基因第24‑27号外显子反向剪接所形成，环化序列有555个碱基。本发明制备了circ‑FOCAD的qRT‑PCR引物以及体外干扰circ‑FOCAD的小干扰RNA(siRNA)。与正常对照相比，circ‑FOCAD在胃癌和结直肠癌病人肿瘤和血浆样本中表达均显著上调。体外实验显示circ‑FOCAD在胃癌和结直肠癌细胞中发挥促癌基因的作用。本发明研究结果表明circ‑FOCAD是一种新的潜在的胃癌和结直肠癌诊断生物标志物和治疗靶点。

技术领域

本发明属于医学技术领域，涉及一种环状RNA FOCAD作为胃癌和结直肠癌诊断生物标志物和治疗靶点的应用。

背景技术

胃肠道肿瘤是最常见和最主要的肿瘤类型，包括胃癌、结肠癌和直肠癌等。根据2018年最新的全球癌症统计报告，在所有恶性肿瘤中，胃癌死亡率位居全球第三，发病率位居全球第五；结直肠癌死亡率位居全球第二，发病率位居全球第三。目前研究表明，胃癌的发生与地域环境及饮食生活因素、幽门螺杆菌感染、癌前病变，以及遗传和基因因素有关。大肠癌的发生与高脂肪低纤维素饮食、大肠慢性炎症、大肠腺瘤、遗传因素和其他因素(如环境因素、吸烟等)有关。具体到分子发病机制，胃癌的分子发病机制包括基因突变(P53，ARID1A，FAT4，CDH1)，肿瘤发生相关信号通路异常(Wnt，RTK，PI3K信号通路)，染色体不稳定(体细胞拷贝数变化，染色体易位)，表观遗传学(错配修复基因CpG岛胞嘧啶甲基化，组蛋白修饰)，微卫星不稳定；结直肠癌的分子发病机制包括癌基因激活(K-ras，c-myc，EGFR)，抑癌基因失活(APC，DCC，P53)，错配修复基因突变(hMLH1，hMSH2，hMSH6，hPMS2)，以及基因过度表达(COX-2、CD44v)等等。然而，上述的分子靶点只有少部分应用于胃癌和结直肠癌的临床实践。因此，有必要探索导致胃癌和结直肠癌发生的其他方面潜在的发病机制。

环状RNA(circular RNA/circRNA)是一类新近发现的内源性非编码RNA。其结构特点为具有闭合的环状结构，没有5’帽子端和3’尾端。这种环状结构是通过上游3’端剪接受体经反向剪接与下游5’端剪接供体连接形成。这种以共价键结合的环状闭合结构导致circRNA比线性RNA更加稳定，不容易被核酸外切酶降解。根据目前的研究，circRNA具有以下基本功能：作为竞争性内源性RNA(ceRNA)吸附microRNA；调控转录及选择性剪接；作用于RNA结合蛋白；翻译成蛋白质。基于以上circRNA的功能，相关研究已经证实circRNA与人类疾病包括肿瘤密切相关。研究表明circRNA是一种潜在的肿瘤生物标志物和治疗靶点。然而，大多数circRNA在癌症中的具体作用机制仍未被阐明，所以深入研究circRNA在胃癌和结直肠癌中的作用机制，对于胃癌和结直肠癌的诊断及治疗都具有潜在的巨大意义。

发明内容

本发明提供了circRNA FOCAD(circ-FOCAD)在胃癌和结直肠癌诊断及治疗方面的应用。本发明公开了circ-FOCAD作为一种新的潜在的胃癌和结直肠癌诊断生物标志物和治疗靶点：circ-FOCAD在胃癌和结直肠癌病人的肿瘤和血浆样本中表达显著上调；受试者工作特征(ROC)曲线显示circ-FOCAD具备良好的诊断胃癌和结直肠癌的潜能；circ-FOCAD促进胃癌和结直肠癌细胞的增殖。

本发明的第一个目的是提供一种胃癌和结直肠癌潜在诊断生物标志物和治疗靶点，其为circ-FOCAD(hsa_circ_0008678|chr9：20923658-20933102+|FOCAD)(核苷酸序列如SEQ ID No.1所示)。circ-FOCAD是由FOCAD基因第24-27号外显子反向剪接所形成，环化序列有555个碱基。