[发明专利]一种与公猪精子活力和总精子数相关的分子标记及应用

说明书

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与公猪精子活力和总精子数相关的分子标记及应用。该分子标记克隆自登陆号为ALGA0001958基因片段。通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与公猪精子活力和总精子数性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为A时，判定猪具有更高的精子活力和更多的总精子数。公开了与猪精液性状相关分子标记的筛选方法及其关联分析。本发明为猪精子活力和总精子数性状的标记辅助选择提供了新的SNP标记资源。

技术领域

本发明涉及猪分子标记制备技术领域，具体涉及一种与公猪精子活力和总精子数相关的分子标记及应用。该分子标记涉及一个SNP的应用。本发明的分子标记可用于公猪精子活力和总精子数性状的标记辅助选择。

背景技术

我国是世界牲猪的第一生产大国,无论是肉猪消费量还是牲猪养殖规模均居世界第一(刘文涛等.关于中国与美国养猪业的比较研究[J].中国畜牧杂志,2016,52(06):3-7)。养猪模式逐渐从小规模猪场和散养户发展到规模化猪场。到2016年，规模化猪场及一体化养猪企业的占比就已超过50％(王瑞年.中国养猪规模化现状分析：试论中小型家庭农场的生存与发展[J].今日养猪业,2018(02):26-29)。

随着规模化猪场的建设和发展，猪人工授精技术的普及与推广对规模化猪场来说意义重大(隋朝辉.规模化猪场开展猪人工授精的意义及步骤[J].现代畜牧科技,2016(01):44)。公猪精液品质的高低，影响了母猪的繁殖性能，一定程度上决定了规模化猪场的经济效益和种猪的遗传改良进展，使得种猪养殖业对公猪精液性状的重视程度在持续提高。

人工授精站的经济效益主要依靠公猪生产精液的能力以及精液质量的好坏(Robinson and Buhr.Impact of genetic selection on management of boarreplacement[J].Theriogenology,2005,63(2):0-678)。据统计，每年因精液品质差导致淘汰的公猪比例为18.0％-26.4％(Koketsu and Sasaki.Boar culling and mortality incommercial swine breeding herds.[J].Theriogenology,2009,71(7):1186-1191)，精液品质差是导致公猪淘汰的主要原因之一。人工授精技术因其减少公猪饲养数量、提高优秀公猪配种效率、减少疾病传播、提高猪场繁殖效率、克服体格大小差异等优点，是实现养猪生产现代化的重要手段。优良的公猪精液，可以提高母猪的繁殖力，降低规模化猪场生产成本，也同时增加人工授精站经济效益。在传统的公猪育种思路中，更多关注的是对生产性状的选择。然而，因为一些生产性状与精液性状间存在负相关关系(Oh et al.Estimates ofGenetic Correlations between Production and Semen Traits in Boar[J].Asian-australasian journal of animal sciences,2005,19(19):160-164)，过度的对公猪生产性状的选择，可能会导致公猪精液质量的下降，使生产母猪年均提供断奶仔猪数(PSY)减少。因此，种公猪的选择理应考虑对公猪精液性状进行改良。

公猪的常规精液性状包括：精液量、精子浓度、精子活力、精子畸形率等，为了更全面的反应公猪精液质量的好坏，通常还将总精子数和有效精子数作为公猪精液性状的评判指标(Smital et al.Differences among breeds and manifestation of heterosis inAI boar sperm output[J].Animal Reproduction Science,2004,80(1):121-130)。