[发明专利]一种与大豆抗胞囊线虫病抗性位点连锁的分子标记的筛选方法、分子标记、引物及应用

权利要求书

1.一种与大豆抗胞囊线虫病抗性位点连锁的分子标记，其特征在于，该分子标记位于大豆第16号染色体J连锁群，所述分子标记为SSR_16_01、SSR_16_02、SSR_16_03、SSR_16_06、SSR_16_07和SSR_16_08中的一种，上述分子标记的多态性SSR引物如下：

①上游引物SSR_16_01-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，下游引物SSR_16_01-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，用于获得SSR_16_01分子标记；

②上游引物SSR_16_02-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示，下游引物SSR_16_02-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示，用于获得SSR_16_02分子标记；

③上游引物SSR_16_03-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示，下游引物SSR_16_03-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示，用于获得SSR_16_03分子标记；

④上游引物SSR_16_06-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：7所示，下游引物SSR_16_06-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：8所示，用于获得SSR_16_06分子标记；

⑤上游引物SSR_16_07-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，下游引物SSR_16_07-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示，用于获得SSR_16_07分子标记；

⑥上游引物SSR_16_08-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示，下游引物SSR_16_08-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示，用于获得SSR_16_08分子标记。

2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述大豆抗胞囊线虫病抗性位点为qSCN16位点，位于大豆第16号染色体31.4697Mb-35.7920Mb区间。

3.一种用于获得与大豆抗胞囊线虫病抗性位点连锁的分子标记的引物，其特征在于，所述引物为下述中的一种：

①上游引物SSR_16_01-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，下游引物SSR_16_01-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示；

②上游引物SSR_16_02-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示，下游引物SSR_16_02-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示；

③上游引物SSR_16_03-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示，下游引物SSR_16_03-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示；

④上游引物SSR_16_06-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：7所示，下游引物SSR_16_06-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：8所示；

⑤上游引物SSR_16_07-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，下游引物SSR_16_07-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示；

⑥上游引物SSR_16_08-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示，下游引物SSR_16_08-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示。

4.权利要求1或2所述的分子标记在筛选大豆抗胞囊线虫基因或大豆抗胞囊线虫病育种中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，具体应用方法包括：提取被测大豆基因组DNA，以东农L-10的基因组DNA为抗病对照样本，以黑农37、绥农10号或绥农14号其中之一的基因组DNA为感病对照样本，与被测大豆种质的DNA同时利用权利要求1所述的分子标记中的一个或多个，经SSR引物PCR扩增后，利用聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染检测分析，根据银染结果鉴定大豆是否具有大豆胞囊线虫抗性，当被测种质扩增条带与抗病对照东农L-10扩增条带一致时，鉴定该大豆为携带抗病等位基因的种质，其抗大豆胞囊线虫病1，3，4和14号生理小种；当扩增条带与感病对照黑农37、绥农10号或绥农14号其中之一的扩增条带一致时，鉴定该大豆携带感病等位基因的种质，其对大豆胞囊线虫病1，3，4和14号生理小种的抗性较低或不具抗性。