[发明专利]一种医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法和系统在审
申请号: | 201910069893.8 | 申请日: | 2019-01-24 |
公开(公告)号: | CN109785942A | 公开(公告)日: | 2019-05-21 |
发明(设计)人: | 曾亮;朱新柳 | 申请(专利权)人: | 邃蓝智能科技(上海)有限公司 |
主分类号: | G16H30/20 | 分类号: | G16H30/20;G16H30/40;G06N20/00 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 201210 上海市浦东新区中国(*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 标注 影像图像 标注信息 存储 医疗影像数据 读取 数据读取 标注框 自定义 数据标注 数据存储 数据转换 学习算法 医疗影像 有效解决 不一致 多通道 有效地 比对 兼容 影像 图像 保存 退出 | ||
1.一种医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法,其特征在于,包括:
(1)数据标注:
A1:数据在标注前,读取影像图像ID;所述影像图像ID包括:PatientId,StudyId,StudyInstanceUid,SeriesInstanceUid,SopInstanceUid信息;
A2:对图像进行标注;标注后,会出现标注框;
A3:自定义标注类型;
(2)数据存储:
B1:将标注信息保存为JSON格式;所述标注信息包括影像图像ID、标注框和自定义标注类型;
(3)数据读取:
C1:数据读取时,将影像图像和JSON文件的ID进行比对,如果一致则进入下一步,如果不一致则退出;
C2:读取并显示标注信息。
2.如权利要求1所述的医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法,其特征在于,步骤A2中进一步包括标注辅助修正:
A21:设定标注的第n个像素为p[n],n≥1,第n个像素的坐标为x[n],y[n];初始标注的长度单位为m个像素;
A22:当标注到第n=m个像素点时,选取第[n-m+1,n]共m个像素点;
A23:计算m个像素点坐标x[n]的最大值和最小值,分别为x[n]max,x[n]min;计算m个像素点坐标y[n]的最大值最小值,分别为y[n]max,y[n]min;
A24:根据x[n]max,x[n]min,y[n]max,y[n]min,得到矩形框;
A25:在矩形框内的像素点中,取两个点作为两类的初始值,这两个点u1,u2的坐标分别为:X1=(x[n]max+x[n]min)/2+3;Y1=(y[n]max+y[n]min)/2;X2=(x[n]max+x[n]min)/2-3;Y2=(y[n]max+y[n]min)/2;
A26:对于矩形框内的点,分别计算像素距离d1=|xi-μ1|2d2=|xi-μ2|2;如果将xi标记最小的为di所对应的类别λi;
A27:分别重新计算新的质心ui的值;
A28:重复第A25-A27步骤,直到ui值不变;
A29:对所有的点计算x=f(i,j)-f(i-1,j-1)y=f(i-1,j)-f(i,j-1);|G(x,y)|=sprt(x^2-y^2);
A210:|G(x,y)|>0为边缘点;
A211:得到的新的m个边界点记为pnew[n],代替之前的m个像素点;
A212:当n>m个像素点时,选取第[n-m+1,n]共m个像素点;
其中,[n-m+1,n-1]个像素点是上一步中已经更新过的点,第m个像素点是人工新标注的点,重复第A23-A26步骤;
A213:循环直到最后一个像素点。
3.如权利要求1所述的医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法,其特征在于,进一步包括:
(4)数据转换:
D1:读取源文件信息,获取其中的各个字段的信息写入内存;
D2:根据数据格式的需求,从内存中读取所需信息;
D3:按照所要的格式输出,保存文件。
4.如权利要求1所述的医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法,其特征在于,进一步包括:
(5)影像多通道处理:
E1:读取影像图像数据以及影像图像数据中保存的影像图像ID;
E2:根据SeriesInstanceID判断出通道的个数以及通道的标识;
E3:根据SopInstanceID判断出属于每个通道的数据;
E4:根据SeriesInstanceID和SopInstanceID将不同通道中的数据做出映射关系,完成同步。
5.如权利要求1所述的医疗影像数据的快速辅助标注及存储方法,其特征在于,步骤(3)数据读取过程中,还包括C3:对标注区域的范围大小做出调整;和/或对标注区域的形状做出调整;和/或增加新的标注区域;和/或删除不合适的区域。
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