[发明专利]一种通用型猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测引物及方法在审
申请号: | 201910071660.1 | 申请日: | 2019-01-25 |
公开(公告)号: | CN109762933A | 公开(公告)日: | 2019-05-17 |
发明(设计)人: | 刘国平;晋钱钱;谢洪涛;常小云;胡利群 | 申请(专利权)人: | 长江大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6848;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉河山金堂专利事务所(普通合伙) 42212 | 代理人: | 胡清堂 |
地址: | 434023 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 猪蓝耳病毒 检测 经典毒株 灵敏度 巢式 高致病性变异株 巢式RT-PCR 抗干扰性能 变异毒株 待测样品 电泳检测 高致病性 检测引物 碱基序列 简并碱基 扩增产物 两对引物 目的基因 特异性强 蓝耳病 通用型 毒株 引物 应用 | ||
1.一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR特异性引物,其特征在于:所述引物根据检测猪蓝耳病病毒NSP2基因中碱基序列得到两对带有简并碱基的引物,所述两对引物,分别为外侧引物PRRSV-O-F、PRRSV-O-R和内侧引物PRRSV-I-F、PRRSV-I-R,具体为:
PRRSV-O-F:AATCTTGARGAATGCTTGGC(SEQ ID NO.1);
PRRSV-O-R:GCTGAGTAYTTTGGGCGTG(SEQ ID NO.2);
PRRSV-I-F:TTCTTTGATTGGRATGTTGTGC(SEQ ID NO.3);
PRRSV-I-R:CAAGGAGCTGCTTGAYGACAC(SEQ ID NO.4);
其中,简并碱基R表示A或G,简并碱基Y表示C或T。
2.一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于:包含以下步骤:
S1、提取待测样品的RNA;
S2、以S1提取的RNA为模板,利用PRRSV-O-F和PRRSV-O-R进行第一轮PCR扩增,对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,若无目的条带则进行第二次扩增;
S3、以S2扩增产物为模板,利用PRRSV-I-F和PRRSV-I-R进行第二轮PCR扩增,对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,依据目的条带来区分毒株类型。
3.根据权利要求2所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于,S2所述PCR反应体系为:2×1Step Buffer 12.5μl,PrimeScript 1Step Enzyme Mix 1μl,20μmol/L的PRRSV-O-F与20μmol/L的PRRSV-O-R各1μl,RNA模板0.5μl,补加RNase Free dH2O至25μl;PCR反应程序为:50℃反转录30min,94℃预变性2min,94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸8min。
4.根据权利要求2所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于,S3所述PCR反应体系为:Mix 12.5μl,20μmol/L的PRRSV-I-F与20μmol/L的PRRSV-I-R各1μl,模板1μl,补加RNase Free dH2O至25μl;PCR反应程序为:94℃预变性2min,98℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸45s,35个循环,72℃延伸8min。
5.根据权利要求4所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于,所述模板为S2中PCR产物稀释50倍。
6.根据权利要求2所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于,S1所述待检测RNA从猪的初乳、精液、血清、组织、恶露等样品中提取。
7.根据权利要求2所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于:S2所述目的条带为1124bp,1034bp或731bp。
8.根据权利要求7所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于:目的条带为1124bp,判定样品中含有猪经典蓝耳病毒;目的条带为1034bp,判定样品中含有猪高致病性蓝耳病毒;目的条带为731bp,判定样品中含有猪类NADC-30蓝耳病毒。
9.根据权利要求2所述的一种猪蓝耳病毒三重巢式RT-PCR检测方法,其特征在于S3所述区分方法具体为:目的条带为1029bp,判定样品中含有猪经典蓝耳病毒;目的条带为939bp,判定样品中含有猪高致病性蓝耳病毒;目的条带为636bp,判定样品中含有猪类NADC-30蓝耳病毒。
10.权利要求1所述引物在制备鉴别猪蓝耳病毒并区分经典毒株、高致病性变异毒株或NADC-30毒株检测试剂盒中的应用。
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