[发明专利]自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备及介质有效

专利信息
申请号: 201910086394.X 申请日: 2019-01-29
公开(公告)号: CN109636801B 公开(公告)日: 2020-04-21
发明(设计)人: 叶德贤 申请(专利权)人: 上海杏脉信息科技有限公司
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T7/13;G06T7/62
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 庞红芳
地址: 202150 上海市崇明区新河镇新开*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 自动 获取 her2 荧光 原位杂交 结果 电子设备 介质
【权利要求书】:

1.一种自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备,其特征在于,包括处理器和存储器,所述存储器存储有程序指令,所述处理器运行程序指令实现如下方法:

分别获取使用荧光显微镜在红色滤光片下拍摄的FISH图片、绿色滤光片下拍摄的FISH图片及蓝色滤光片下拍摄的FISH图片;

从所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出HER2基因信号,从所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出CEP17基因信号,从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞;

根据检测出的所述肿瘤细胞获取所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的HER2基因信号,形成HER2基因判断信号,获取所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的CEP17基因信号,形成CEP17基因判断信号;

根据所述HER2基因判断信号、所述CEP17基因判断信号以及HER2基因是否为阳性的判断标准获取HER2荧光原位杂交结果;

根据检测出的所述肿瘤细胞获取所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的HER2基因信号,形成HER2基因判断信号的一种实现方式包括:

根据所述检测到的肿瘤细胞的位置生成对应掩码;

根据所述掩码滤除所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中所述肿瘤细胞位置以外的HER2基因信号,所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中剩余的HER2基因信号形成HER2基因判断信号;

所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中剩余的HER2基因信号形成HER2基因判断信号具体包括:

获取所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中剩余的各个HER2基因信号的轮廓区域面积;

对各所述轮廓区域面积的大小进行排序,取所述轮廓区域面积的中位数作为阈值;

根据所述阈值对大于所述阈值的所述轮廓区域面积进行估算,确定大于所述阈值的所述轮廓区域面积中包含的HER2基因信号数量;

根据确定的HER2基因信号数量确定所述HER2基因判断信号。

2.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备,其特征在于,所述从所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出HER2基因信号的一种实现方式包括:

对所述红色滤光片下拍摄的FISH图片抽取红色通道并抑制其他通道的干扰,形成红色通道图片;

对所述红色通道图片进行信号边缘检测,确定所述红色通道图片中信号区域;

计算所述信号区域内的平均灰度值,并将所述平均灰度值作为阈值进行阈值化处理,得到所述HER2基因信号。

3.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备,其特征在于,所述从所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出CEP17基因信号的一种实现方式包括:

对所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片抽取绿色通道并抑制其他通道的干扰,形成绿色通道图片;

对所述绿色通道图片进行信号边缘检测,确定所述绿色通道图片中信号区域;

计算所述信号区域内的平均灰度值,并将所述平均灰度值作为阈值进行阈值化处理,得到所述CEP17基因信号。

4.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备,其特征在于,所述从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞的一种实现方式包括:

通过预设的肿瘤细胞检测模型从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞。

5.根据权利要求4所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的电子设备,其特征在于,所述肿瘤细胞检测模型的一种获取过程包括:

将多个蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中的肿瘤细胞通过标注框进行标注,获得训练图片集;

通过所述训练图片集对目标检测神经网络模型进行训练,得到肿瘤细胞检测模型。

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