[发明专利]利用差异性表达的肠道梭菌进行生物体低剂量辐射的预警及应用有效
申请号: | 201910091482.9 | 申请日: | 2019-01-30 |
公开(公告)号: | CN109810970B | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 周平坤;刘晓丹;黄瑞雪 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | C12N13/00 | 分类号: | C12N13/00;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 刘鑫;李辉 |
地址: | 100850 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 差异性 表达 肠道 进行 生物体 剂量 辐射 预警 应用 | ||
1.一种利用差异性表达的肠道梭菌进行低剂量辐射预警胃肠道疾病预警模型的构建方法,其包括以下步骤:
步骤一,对小鼠进行不同时间、不同低剂量Co60射线长期慢性照射,检测生物肠道菌群各项指标,并与辐射时间进行差异性对比分析,明确低剂量辐射暴露引起小鼠肠道菌群差异性表达改变情况;
步骤二,在肠道菌群属的水平上,根据差异性表达改变情况构建肠道梭菌丰度与辐射时间之间的时间-效应关系,构建肠道梭菌丰度与辐射剂量之间的剂量-反应关系;
步骤三,根据时间-效应关系和剂量-反应关系,通过逐步回归法构建预警模型;
其中,预警模型中的因变量为肠道梭菌的数量,自变量为所述肠道梭菌的Species指数水平、OTU指数水平、Shannon指数水平和Simpson指数水平及辐射时间和辐射剂量指数;
进行差异性对比分析具体步骤为:
将辐射各组的小鼠的肠道菌群各项指标取均值和标准值,使用SPSS软件计算各组之间的均值和标准差,采用t检验将辐照各组小鼠的指标变化情况与对照组小鼠进行对比,当p<0.05时定为有显著性差异,从而明确低剂量辐射暴露引起小鼠肠道菌群差异性表达改变情况;
采用SPSS软件进行逐步回归法构建预警模型,通过比较各个自变量对因变量肠道梭菌的数量的线性影响显著性,在保证整体最优的条件下,选择对因变量的影响较为显著的自变量进行回归;
所述生物肠道菌群各项指标包括Species指数水平、OTU指数水平、Shannon指数水平和Simpson指数水平;
不同低剂量包括0.05Gy、0.1Gy和0.5Gy;
不同辐射时间包括0d、7d、21d和35d;
该方法构建获得的预警模型如下:
Y=-15.59+0.0001×B+0.186×C+19×D+0.003×E+3.025×F+0.037×G
其中,Y为肠道梭菌的数量;B为Species指数水平;C为Shannon指数水平;D为Simpson指数水平;E为OTU指数水平;F为辐射剂量指数;G为辐射时间。
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