[发明专利]一种与重金属中毒易感性相关的SNP位点及其应用

说明书

本申请公开了一种与重金属中毒易感性相关的SNP位点及其应用。所述SNP位点为TRPV5基因第103位核苷酸C＞T，所述TRPV5基因的序列如SEQ ID No.10所示。所述SNP位点的C与T在高血铅组和低血铅组间的差异极显著，其中，C为铅中毒易感等位基因或铅中毒高风险等位基因，T为非铅中毒易感等位基因或铅中毒低风险等位基因。因此通过检测该位点的碱基类型、判断该位点的基因型可用于检测重金属(如铅)中毒易感性或重金属中毒风险、筛查重金属中毒患者、鉴定或辅助鉴定重金属中毒易感基因、检测与重金属中毒或代谢相关的单核苷酸多态性。本发明所提供的应用和产品在重金属中毒易感人群识别，从而合理预防重金属中毒方面具有重要价值。

技术领域

本发明属于生物医学分子检测技术领域，具体涉及一种与重金属中毒易感性相关的SNP位点及其应用。

背景技术

重金属原义是指比重大于5的金属(一般来讲密度大于4.5克每立方厘米的金属)，包括金、银、铜、铁、汞、铅、镉等，重金属在人体中累积达到一定程度，会造成慢性中毒。在环境污染方面所说的重金属主要是指汞(水银)、镉、铅、铬以及类金属砷等生物毒性显著的重元素。重金属非常难以被生物降解，相反却能在食物链的生物放大作用下，成千百倍地富集，最后进入人体。重金属在人体内能和蛋白质及酶等发生强烈的相互作用，使它们失去活性，也可能在人体的某些器官中累积，造成慢性中毒。在相同的重金属暴露水平上，不同的人群表现出不同的生物学效应，这在很大程度上取决于人群的遗传易感性。寻找重金属中毒的遗传易感因素有助于早期识别易感人群，有助于制定相应的预防措施保护易感人群。

TRPV5是瞬时性受体电位(TRP)通道超家族成员中TRPV亚家族通道中一员，该通道蛋白由729个氨基酸构成，分子量约为83kDa。相应的基因由在7q34染色体排列的15个外显子组成，主要分布于肾脏、破骨细胞、胎盘等。其中，肾小管中分布较高，另在破骨细胞中也有表达，其表达量虽不如在肾脏的高表达，但也提示TRPV5是介导破骨细胞骨吸收的重要通道蛋白。研究证实其与肾脏中Ca²⁺主动重吸收相关。首先，钙离子通过TRPV5进入细胞后，结合到钙结合蛋白D28K上弥散到基底外侧膜。然后，钙离子经钠钙交换器(Na⁺/Ca²⁺exchanger1,NCX1)和ATP依赖性质膜Ca²⁺-ATPase 1b(PMCA1b)排出细胞外，研究表明，Ca²⁺转运蛋白的表达取决于TRPV5调控的Ca²⁺涌入以及TRPV5的表达。

目前，尚无研究表明TRPV5基因多态性与重金属(如铅)中毒易感性相关。

发明内容

本发明的目的在于提供检测一种新SNP在检测重金属中毒易感性中的应用。

本申请发明人在研究中发现：人TRPV5基因(DNA序列如SEQ ID No.10所示)上存在两个新的SNP位点：g.103(C＞T)(SEQ ID No.10所示序列的第103位C突变为T)和g.654(G＞A)(SEQ ID No.10所示序列的第654位G突变为A)。随后通过病例-对照分析证明上述两个SNP位点的多态性或基因型与重金属(铅)中毒易感性相关。

SEQ ID No.10所示的TRPV5基因的15个外显子分别为：SEQ ID No.10所示DNA的第265-392位，第3278-3375位，第3544-3666位，第4159-4296位，第4604-4702位，第4858-5033位，第5490-5636位，第7983-8195位，第18156-18242位，第18341-18417位，第18678-18843位，第19018-19084位，第20974-21242位，第24128-24234位，和第24916-25210位。

因此，本发明保护一种与重金属中毒易感性相关的SNP位点，所述SNP位点为TRPV5基因第103位核苷酸C＞T。

进一步的，所述TRPV5基因的序列如SEQ ID No.10所示。