[发明专利]血液中circ_SLC7A5分子标志物在诊断食管鳞癌及预后中的应用有效
申请号: | 201910095508.7 | 申请日: | 2019-01-31 |
公开(公告)号: | CN109652554B | 公开(公告)日: | 2019-10-18 |
发明(设计)人: | 康宁;朱桂芳;曹秀峰 | 申请(专利权)人: | 江苏万成生物医学研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 叶涓涓 |
地址: | 210000 江苏省南京市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子标志物 食管鳞癌 预后 血液 内镜 应用 实时定量PCR 食管癌 血浆标志物 诊断 分子预警 检测引物 鳞状细胞 目标人群 医疗资源 食管 依从性 癌变 筛查 病理 合成 痛苦 检测 医疗 检查 进程 发现 | ||
本发明公开了一种血液中circ_SLC7A5分子标志物在诊断食管鳞癌及预后中的应用,涉及circ_SLC7A5分子标志物的发现、检测、应用,设计并合成出特异性用于实时定量PCR的检测引物。血液中的circ_SLC7A5可作为ESCC患者的血浆标志物,针对目标人群对食管癌内镜筛查依从性差,以及临床上确诊的食管鳞癌患者绝大多数都是中晚期的现状,在食管鳞状细胞癌变进程中找到理想的分子预警信号,有针对性的进行内镜检查,病理确诊,以减轻病人痛苦,避免过度医疗,节省医疗资源。
技术领域
本发明涉及肿瘤分子生物学领域,具体为一种血液中circ_SLC7A5分子标志物在诊断食管鳞癌及预后中的应用。
背景技术
食管癌是严重威胁人类健康的最常见恶性肿瘤之一,主要有两种病理分型:鳞癌和腺癌。90%的食管癌是鳞状细胞癌,其分布具有明显的地域差异。我国ESCC发病率占全世界70%以上,预后较差,5年总体生存率只有15%-25%。2016年临床医师癌症杂志报道,食管癌已经成为中国发病率最高的五种肿瘤之一,其发病率在男性中排第三位,女性中排第五位。
环状RNA(circRNAs)是一种新的内源性非编码RNA,在20世纪90年代早期被确定为乱序外显子的转录本,其结构、功能和机制被相继报道,成为后来20年的研究热点。不同于以5'端和3'端为末端的传统线性RNA,circRNAs是缺少5'端帽和3'端poly(A)尾的特殊闭环结构[7],且与哺乳动物细胞中微小RNA(miRNAs)和长链非编码RNA(lncRNAs)相比,具有更高的稳定性和序列保守性,是因为它们具有核酸酶抗性。近期大量研究报道,在不同物种中circRNAs均有表达。基于生物信息学分析和高通量测序技术的迅速发展,研究人员发现了数以万计的circRNAs,发现它们参与血管病变、神经系统疾病、肿瘤等疾病发生发展。CircRNAs芯片分析技术已应用于许多肿瘤,包括消化系统肿瘤,神经系统肿瘤,泌尿系统肿瘤,头颈部肿瘤等,如下咽鳞状细胞癌、喉鳞状细胞癌、基底细胞癌、胰腺导管腺癌、胃癌、肝细胞癌、甲状腺乳头状癌等。然而,在食管鳞癌中,circRNAs鲜有报道。
目前ESCC尚没有血浆肿瘤标志物来评估病情,内镜是金标准,但是创伤大,患者不易接受。
发明内容
为解决上述问题,本发明公开了一种血液中circ_SLC7A5分子标志物在诊断食管鳞癌及预后中的应用,针对目标人群对食管癌内镜筛查依从性差,以及临床上确诊的食管鳞癌患者绝大多数都是中晚期的现状提出,在食管鳞状细胞癌变进程中找到理想的分子预警信号,有针对性的进行内镜检查,病理确诊,以减轻病人痛苦,避免过度医疗,节省医疗资源。血浆中的circ_SLC7A5可作为ESCC患者的血浆标志物,这一检查方法容易被受检者接受,更可成为ESCC患者的早诊、病情进展的判断以及预后评估的有效手段。
为了达到以上目的,本发明供如下技术方案:
一种血液中circ_SLC7A5分子标志物在诊断食管鳞癌及预后中的应用,所述circ_SLC7A5分子标志物的核苷酸序列为SEQ ID NO.1。circ_SLC7A5的ID号为circ_0040796。
在本发明中,用于食管鳞癌诊断或者预后的试剂为实时定量PCR试剂盒。
本发明的根据核苷酸序列为SEQ ID NO.1的circ_SLC7A5分子标志物设计了2对引物用于检测该序列,引物核苷酸序列为SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ IDNO.5。
特异性引物分别如下:
本发明还公开了一种circ_SLC7A5分子标志物的检测方法,包括样品总RNA提取、RNA反转录、实时定量PCR扩增。
具体方法如下:第一步,总RNA提取
a.血浆总RNA提取
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