[发明专利]一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的系统

说明书

本发明提供了一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的系统，使用本发明系统对患有结肠直肠癌的患者进行分型能够显示出显著的性能，分型为高复发风险型和低复发风险型的患者5年内无复发生存率有显著不同。

技术领域

本发明涉及一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的系统。

背景技术

结直肠癌是世界上第三大常见癌症(Ferlay et al.,2013)。大约三分之一的新病例被诊断为2期疾病，而单纯手术切除后2期结直肠癌患者5年生存率约为 60-80％，因此，只有大约25％的2期结直肠癌患者会需要辅助治疗(Labianca et al.,2013)。确定手术后有高风险复发的2期结直肠癌患者可以用来选择可能得益于手术后辅助治疗的患者亚群，但是目前临床上广泛应用的患者临床病理参数，例如，淋巴结数量，组织学分级，肿瘤浸润深，邻近器官受侵，并不能准确预测预后和准确选择具有高复发风险的患者接受辅助治疗。因此本发明提供可以对结肠直肠癌患者的肿瘤样本的分型方法，从而确定所述的高复发风险的患者和低复发风险的患者。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的系统，采用本发明的系统对患有结肠直肠癌的患者进行分型，将所述患者分类为具有高复发风险的患者和低复发风险的患者，高复发风险的患者亚群是应在手术后进行治疗的患者。

为实现上述目的，所采取的技术方案：一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的系统，包括

数据输入模块，用于将患有结肠直肠癌的患者的组织样本中第一生物标志物的RNA表达水平与五年内有疾病复发并且低细胞周期活动的患者的组织样本中所述第一生物标志物的RNA表达水平之间的第一相似性值、以及所述患有结肠直肠癌的患者的组织样本中所述第一生物标志物的RNA表达水平与五年内疾病未复发的患者的组织样本中所述第一生物标志物的RNA表达水平之间的第二相似性值输入模型计算模块，所述第一生物标志物包括表1中列出的至少3个基因；用于将所述患有结肠直肠癌的患者的组织样本中第二生物标志物的RNA 表达水平与五年内有疾病复发并且非低细胞周期活动的患者的组织样本中所述第二生物标志物的RNA表达水平之间的第三相似性值、以及所述患有结肠直肠癌的患者的组织样本中所述第二生物标志物的RNA表达水平与五年内疾病未复发的患者的组织样本中所述第二生物标志物的RNA表达水平之间的第四相似性值输入模型计算模块，所述第二生物标志物包括表2中列出的至少3个基因；

模型计算模块，包括分型模型，用于根据第一相似性值、第二相似性值、第三相似性值、第四相似性值以及分型模型计算患有结肠直肠癌的患者的第一分型得分值和第二分型得分值；所述第一分型得分值＝第一相似性值-第二相似性值，所述第二分型得分值＝第三相似性值-第四相似性值；

结果输出模块，用于根据患有结肠直肠癌的患者的第一分型得分值和第二分型得分值判定患者具有不良预后或者具有良好预后，当患有结肠直肠癌的患者的第一分型得分值≥第一相似性阈值，或/且患有结肠直肠癌的患者的第二分型得分值≥第二相似性阈值时，患者分类为高复发风险，具有不良预后；当患有结肠直肠癌的患者的第一分型得分值＜第一相似性阈值，且患有结肠直肠癌的患者的第二分型得分值＜第二相似性阈值时，患者分类为低复发风险，具有良好预后。

优选地，所述第一相似性阈值＝0.155，所述第二相似性阈值＝0.076。

本发明提供了一种用于对患有结肠直肠癌的患者进行分型的方法，包括以下步骤：

(1)提供从所述患者的肿瘤样本提取的RNA样本，所述肿瘤样本包括结肠直肠癌细胞；

确定所述RNA样本中生物标志物的RNA表达水平，其中，所述生物标志物包括表1中列出的至少3个基因；

确定所述生物标志物的RNA表达水平与5年内有疾病复发并且低细胞周期活动的患者的所述生物标志物的RNA表达水平之间的相似性值a；