[发明专利]一种基于LBP-Adaboost算法的数字PCR液滴检测方法有效
申请号: | 201910118093.0 | 申请日: | 2019-02-15 |
公开(公告)号: | CN109903296B | 公开(公告)日: | 2021-06-01 |
发明(设计)人: | 高鹏;夏江 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/62;G06K9/62;G16B25/20 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 陆惠中;王永伟 |
地址: | 310000 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 lbp adaboost 算法 数字 pcr 检测 方法 | ||
1.一种基于LBP-Adboost算法的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1:Adaboost训练基于LBP特征的液滴正负样本,生成级联分类器;
S2:基于共生矩阵分割液滴“有效区域”,生成二值化图像;
S3:液滴图像划分为子图像,每一子图像分别加载级联分类器,计算被检液滴的位置和灰度值;
S4:依据“有效区域”内液滴位置计算液滴的半径和体积;
S5:计算所有液滴的总体积和目标基因浓度;
所述步骤S1包括:
S11.在稳定的成像系统条件下,拍摄不同曝光时间、不同浓度梯度的灰度图像;
S12.截取包含完整液滴的正样本,归一化为同一尺寸24*24;
S13.提取样本的LBP特征;
S14.依据Adaboost算法生成线性加权的强分类器;
S15.训练多个强分类器,组成级联分类器;
所述步骤S2包括:
S21.图像预处理;
S22.共生矩阵分割液滴区域;
S23.生成二值化图像;
所述步骤S4包括:
S41.将步骤三定位的所有液滴点映射到步骤二生成的二值化图像中;
S42.统计距离液滴D(i)小于50个像素的液滴,计算它们之间距离的平均值;
S43.D(i)半径表示第i个液滴的半径,D(i)体积表示第i个液滴的体积,其中π=3.14;
S44.遍历所有的液滴,计算每一个液滴的半径和体积。
2.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S3包括:
S31.图像灰度化;
S32.图像划分为相互重叠的子块;
S33.重叠区域的液滴可能被多次定位。
3.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S5包括:
S51.计算目标基因的总体积;
S52.计算目标基因的浓度。
4.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S13包括:
S131.设坐标点(x,y)表示24*24大小的样本位置;
S132.以点(x,y)为中心,将相邻的八个像素的灰度值与阈值P(x,y)比较;
S133.遍历其他位置的像素点,生成LBP值,组合LBP值生成样本LBP特征。
5.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S14包括:
S141.对于给定液滴的正、负样本集(x1,y1),(x2,y2),…,(xi,yi),…,(xn,yn),其中xi表示第i个样本,yi=0表示其为负样本,yi=1表示其为正样本,n表示正负样本的总数;
S142.初始化权重,和表示正样本权重,l为正样本总数;表示正负样本的权重,m为负样本的总数;
S143.通过T次迭代生成强分类器。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于领航基因科技(杭州)有限公司,未经领航基因科技(杭州)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910118093.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。