[发明专利]一种基于LBP-Adaboost算法的数字PCR液滴检测方法有效

专利信息
申请号: 201910118093.0 申请日: 2019-02-15
公开(公告)号: CN109903296B 公开(公告)日: 2021-06-01
发明(设计)人: 高鹏;夏江 申请(专利权)人: 领航基因科技(杭州)有限公司
主分类号: G06T7/11 分类号: G06T7/11;G06T7/62;G06K9/62;G16B25/20
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 陆惠中;王永伟
地址: 310000 浙江省杭州市江*** 国省代码: 浙江;33
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 基于 lbp adaboost 算法 数字 pcr 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于LBP-Adboost算法的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:

S1:Adaboost训练基于LBP特征的液滴正负样本,生成级联分类器;

S2:基于共生矩阵分割液滴“有效区域”,生成二值化图像;

S3:液滴图像划分为子图像,每一子图像分别加载级联分类器,计算被检液滴的位置和灰度值;

S4:依据“有效区域”内液滴位置计算液滴的半径和体积;

S5:计算所有液滴的总体积和目标基因浓度;

所述步骤S1包括:

S11.在稳定的成像系统条件下,拍摄不同曝光时间、不同浓度梯度的灰度图像;

S12.截取包含完整液滴的正样本,归一化为同一尺寸24*24;

S13.提取样本的LBP特征;

S14.依据Adaboost算法生成线性加权的强分类器;

S15.训练多个强分类器,组成级联分类器;

所述步骤S2包括:

S21.图像预处理;

S22.共生矩阵分割液滴区域;

S23.生成二值化图像;

所述步骤S4包括:

S41.将步骤三定位的所有液滴点映射到步骤二生成的二值化图像中;

S42.统计距离液滴D(i)小于50个像素的液滴,计算它们之间距离的平均值;

S43.D(i)半径表示第i个液滴的半径,D(i)体积表示第i个液滴的体积,其中π=3.14;

S44.遍历所有的液滴,计算每一个液滴的半径和体积。

2.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S3包括:

S31.图像灰度化;

S32.图像划分为相互重叠的子块;

S33.重叠区域的液滴可能被多次定位。

3.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S5包括:

S51.计算目标基因的总体积;

S52.计算目标基因的浓度。

4.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S13包括:

S131.设坐标点(x,y)表示24*24大小的样本位置;

S132.以点(x,y)为中心,将相邻的八个像素的灰度值与阈值P(x,y)比较;

S133.遍历其他位置的像素点,生成LBP值,组合LBP值生成样本LBP特征。

5.根据权利要求1所述的数字PCR液滴检测方法,其特征在于,所述步骤S14包括:

S141.对于给定液滴的正、负样本集(x1,y1),(x2,y2),…,(xi,yi),…,(xn,yn),其中xi表示第i个样本,yi=0表示其为负样本,yi=1表示其为正样本,n表示正负样本的总数;

S142.初始化权重,和表示正样本权重,l为正样本总数;表示正负样本的权重,m为负样本的总数;

S143.通过T次迭代生成强分类器。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于领航基因科技(杭州)有限公司,未经领航基因科技(杭州)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910118093.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top