[发明专利]一种用于检测乙型流感病毒的RPA引物、探针、试剂盒及应用在审
申请号: | 201910129832.6 | 申请日: | 2019-02-21 |
公开(公告)号: | CN109797245A | 公开(公告)日: | 2019-05-24 |
发明(设计)人: | 孙宁;李晓军;王卫萍;姚新月;陈芳芳;杨阳 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军东部战区总医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 万婧 |
地址: | 210000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型流感病毒 引物 检测 探针 试剂盒 可用 分子生物学检测 快速检测 探针序列 特异性强 下游引物 灵敏度 扩增 耗时 应用 | ||
1.一种用于检测乙型流感病毒的RPA引物,其特征在于,所述RPA引物核酸序列为:上游引物:B-F:5’-TCTGCTGGAATTGAAGGGTTTGAGCCATAC-3’,下游引物:B-R:5’-TCAAACGGAACTTCCCTTCTTTCTGAGTGT-3’。
2.一种用于检测乙型流感病毒RPA探针,其特征在于,所述RPA探针的核酸序列为SEQID NO.2:5’-GTTCCTCAAATAGCAACTGTCCGAAATACAATTGGACCGATTACCCTT-3’。
3.一种用于同时检测乙型流感病毒和甲型流感病毒的多重RPA引物和探针,其特征在于,包括权利要求1所述的引物和权利要求2所述的探针,还包括甲型流感病毒的RPA引物和探针。
4.根据权利要求3所述的一种用于同时检测乙型流感病毒和甲型流感病毒的多重RPA引物和探针,其特征在于,所述的甲型流感病毒的RPA引物核酸序列为:上游引物序列为:MF146:5’-GGCTCTCATGGAATGGCTAAAGACAAGAC-3’,下游引物序列为:MR425:5’-TTGTATATGAGGCCCATGCAACTGGCAAGTG-3’,所述的甲型流感病毒的探针序列为:SEQ ID NO.1:5’-TTCACGCTCACCGTGCCCAGTGAGCGAGGACTGCAGCGTAGACGCTTTG-3’。
5.含有权利要求1-4任一项权利要求所述的引物或探针的试剂盒。
6.一种检测乙型流感病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测病毒的RNA;
(2)RPA扩增:合成权利要求1和权利要求2所述的引物和探针,以提取待测样本的RNA为模板,进行逆转录反应,合成cDNA,而后采用乙型流感病毒RPA扩增体系扩增,RPA扩增采用权利要求1所述的引物和权利要求2所述的探针;
(3)分析上述扩增产物。
7.一种同时检测甲型和乙型流感病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测病毒的RNA;
(2)RPA扩增:合成权利要求4所述的用于检测甲型流感病毒和乙型流感病毒的多重RPA引物和探针,以提取的待测样本的RNA为模板,进行逆转录反应,而后采用甲型和乙型流感病毒双重RPA扩增体系扩增,双重RPA扩增采用权利要求4所述的引物和探针,所述的甲型和乙型流感病毒探针的修饰物不同,所述的甲型和乙型流感病毒的探针的3’端分别标记有间臂Spacer(C3),甲型流感病毒探针序列的32位置以及乙型流感病毒探针序列的33位置的胸腺嘧啶替换为四氢呋喃;
(3)分析上述扩增产物。
8.根据权利要求7所述的同时检测甲型和乙型流感病毒的方法,其特征在于,步骤(3)分析方法采用核酸免疫侧流层析试纸进行检测分析。
9.根据权利要求8所述的同时检测甲型和乙型流感病毒的方法,其特征在于,用于检测甲型和乙型流感病毒的RPA下游引物的5’端均标记有Biotin,用于检测甲型和乙型流感病毒的RPA探针的修饰物分别为FITC和DIG,核酸免疫侧流层析试纸上的两条检测线上分别喷涂Anti-FITC和Anti-DIG,核酸免疫侧流层析试纸上金标垫上喷涂有BSA,质控线上喷涂B-BSA。
10.根据权利要求9所述的同时检测甲型和乙型流感病毒的方法,其特征在于,核酸免疫侧流层析试纸上喷涂的Anti-FITC的浓度为至少为12.5ng/strip,Anti-DIG的浓度至少为75ng/strip,B-BSA的浓度至少为50ng/strip,核酸侧流层析时间至少为5分钟;双重RPA扩增的温度为35-45℃,双重RPA扩增的时间至少为5分钟,双重RPA扩增的所用的引物浓度分别为:甲型流感病毒RPA上下游引物终浓度各为50-200nM,乙型流感病毒RPA上下游引物终浓度各为50-200nM。
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