[发明专利]PTPRJ基因作为猪免疫相关性状的分子标记及其应用

说明书

本发明属于猪分子标记筛选领域，具体涉及PTPRJ基因作为猪免疫相关性状的分子标记及其应用。本发明的分子标记克隆自PTPRJ基因的一个片段。其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第134碱基位处发生一个等位基因突变，即T/G突变。该基因的SNP突变位点获得的分子标记与猪的免疫相关性状相关。对该分子标记进行了关联分析，发现此多态位点与猪的T淋巴细胞亚型含量、嗜碱性粒细胞数、中性粒细胞百分比、嗜碱性粒细胞百分比、白介素‑10含量、80日龄体重这六个性状呈极显著相关。本发明的分子标记可作为检测猪免疫性状的相关标记，可用于猪的标记辅助育种上。

技术领域

本发明涉及猪分子标记筛选领域，具体涉及PTPRJ基因作为猪免疫相关性状的分子标记 及其应用。本发明所述的分子标记可用于猪免疫相关性状的检测。

背景技术

世界上生猪养殖业蓬勃发展的同时，也暴露出一些不可忽略的问题。随着生活水平的提 高，人们的消费观念发生了明显转变，在对肉制品的要求上，瘦肉率甚至口感已经不再处于 第一考量，营养、绿色、健康逐渐成为推动行业升级的方向标。传统养殖方式中疫苗、抗生 素等的大量使用明显和大方向不符。在生猪饲养期间，对于疾病处理方面，不规范使用甚至 滥用疫苗和抗生素导致了猪体内药物残留，间接对人类造成影响，同时，预混于饲料中的抗 生素残留风险也一种额外威胁，有可能诱发共生菌产生耐药性。早在2015年，美国食品及药 物管理局(FDA)就提案建议在鸡肉、牛肉和猪肉生产中减少抗菌促生长剂的使用量，欧盟 正极力限制第三代头孢菌素在兽药上的使用，荷兰经济部、农业部和创新部也建议减少抗生 素的使用量，其中一项措施可能是禁止在饲料内预混药物(黎先伟，2015)。2018年中国农 科院饲料研究所启动了饲用抗生素替代研究项目。可以看出，饲用抗生素导致的食品安全和 环境安全问题已经在国内外受到了重视。

PTPRJ基因编码受体型酪氨酸磷酸酶J，该酶广泛存在于多种细胞类型中(Lin J等，2004)， 它有多种底物，包括PDGF b受体(Kovalenko M等，2000)、肝细胞生长因子(HGF)受体 (Palka HL等，2003)、血管内皮生长因子(VEGF)受体-2(Lampugnani MG等，2006) 等，是介导细胞基质间相互作用的重要信号分子(Larsen M等，2003)。PTPRJ在血管内皮 细胞中的表达水平对于血管发生具有重要作用：低到中度表达水平促进血管内皮钙黏蛋白相关血管生成；高表达水平抑制血管内皮细胞生长因子受体磷酸化激活，对血管内皮细胞生长 因子相关血管生成起负性调控作用(许小兵等，2017)。

PTPRJ也是一种肿瘤抑制基因，它已经在包括乳腺癌在内的一系列癌症研究中被发现 (Chanel E.Smart等，2012)。PTPRJ通过负调控与增殖信号有关的几种蛋白，表现出抑癌 活性，其可以与癌症中广泛表达的CD98hc相互作用，PTPRJ过表达可显著降低A549肺癌细 胞中CD98hc蛋白水平，还能显著降低肺癌细胞的增殖和诱导凋亡，有助于阐明肿瘤细胞中 PTPRJ信号通路(Sabrina等，2018)。在人和小鼠组织中，巨噬细胞的PTPRJ表达量最高(Dave RK等，2009)，敲除试验表明其在单核细胞活化中发挥了与CD45类似的积极作用，可使酪 氨酸Src家族的负调控激酶去磷酸化(Stepanek O等，2011)。Richa K等人在2013年报导， PTPRJ/CD148是具有肿瘤抑制样活性的酪氨酸磷酸酶，各种细胞和组织的定量PCR试验显 示它优先在富含巨噬细胞的组织中表达；在淋巴组织内，免疫组化学试验显示PTPRJ/CD148 与F4/80共定位，同样表明巨噬细胞最强烈地表达PTPRJ蛋白质；并且PTPRJ基础水平不 仅在巨噬细胞中表达最高，还能通过脂多糖(LPS)和其他Toll样受体配体处理后进一步升 高。巨噬细胞是识别、吞噬和破坏外来微生物及其产物的关键细胞，它们是人体免疫系统的 重要组成部分。巨噬细胞不仅有吞噬功能还具有抗原呈递的额外作用，因此对先天免疫反应 和后天免疫反应发挥最佳功能起着关键作用(Stoy N等，2001)。