[发明专利]薄壳山核桃品种Davis的特征序列、标记引物及鉴定方法在审
申请号: | 201910130932.0 | 申请日: | 2019-02-22 |
公开(公告)号: | CN109706262A | 公开(公告)日: | 2019-05-03 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 浙江省林业科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
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地址: | 310023 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 薄壳山核桃 分子特异性标记引物 特征序列 标记引物 分子手段 快速鉴定 上游引物 特征辨别 下游引物 鉴别 替代 | ||
1.薄壳山核桃品种Davis的特征序列,其序列如下:5’-AATTCTGTTAGGAATTTCCTGAAAGCAGCCACAACATATTGGCAAGGATATTTCTATGCAAAATAGTTATTGTGTTAAAATAAGGTCTCCATTAGATCGTGCACAGTAAAGACAGTAATATCAAACTAAAGTATATATATATACACTATTTCTTTTCTTTTCCCTCACCTAATTCCTTCATACTAATTAACCACATTTACACTTTTATTTGAAGAACATTAAAAGGTTATAATATTATCAAAATTATATAATATTATACTCTTTTTAAGGGGTTGTTTAGATTCAGAAACCATCTTATCTTATTTTATCTCATCTCATTATTATAACTGTATCAAATTTTTATACAAAATATAATGACCACCTCGTACACATGTCTTCGAATTATCATGTTTTGTCATGT-3’ 。
2.薄壳山核桃品种Davis的分子特异性标记引物,所述引物序列如下:
上游引物:5′-TCCTGAAAGCAGCCACAACA-3′;
下游引物:5′- GACATGTGTACGAGGTGGTCA-3′。
3.一种利用权利要求2所述的分子特异性标记引物对薄壳山核桃品种Davis进行快速鉴定的方法,所述方法为:提取待测薄壳山核桃品种叶片的基因组DNA作为模板,以所述分子特异性标记引物作为扩增引物,进行PCR扩增,对扩增产物8FDB行电泳检测,若电泳结果出现唯一359bp的特异DNA条带,则待测薄壳山核桃品种为薄壳山核桃品种为Davis,反之则否;所述分子特异性标记引物序列为:
上游引物:5′-TCCTGAAAGCAGCCACAACA-3′;
下游引物:5′- GACATGTGTACGAGGTGGTCA-3′。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于所述PCR扩增条件如下:94℃预变性300s后,95℃变性10s,56℃退火时间50s,72℃延伸40s,共循环30次,最后在72℃补平300s;终止温度为4℃。
5.如权利要求3,4所述的方法,其特征在于所述方法如下:
取待测薄壳山核桃叶片,加液氮磨碎,基因组DNA的提取采用bioteke新型快速植物基因组DNA提取试剂盒的操作说明;
以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,以所述分子特异性标记引物作为扩增引物,进行PCR扩增:
PCR反应体系每15μl组成如下:
2×TsingKE master mix 7.5μl
10 μlM上、下游引物 各0.2μl
20 ng/μl模板DNA 2μl
dd H2O 4.3μl;
PCR扩增条件如下:
94℃预变性300s后,95℃变性10s,56℃退火时间50s,72℃延伸40s,共循环30次,最后在72℃补平300s;终止温度为4℃;
取步骤(2)扩增产物3μl,与1μl 0.25%溴酚兰缓冲液混匀,点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于1×TAE缓冲液中、5V/cm电压下电泳,电泳结束后EB染色,于自动凝胶成像系统上照相,若电泳结果出现唯一359bp的DNA条带,则待测薄壳山核桃品种为Davis,反之则否。
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