[发明专利]FSHR基因特异SNP标记、吐鲁番黑羊产羔数性状的检测方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201910130965.5 申请日: 2019-02-20
公开(公告)号: CN109735633B 公开(公告)日: 2022-04-26
发明(设计)人: 刘武军;马海玉;方超;刘玲玲;王琼;曹行;吕士鹏;于茜;黄开飞;蒋芳芳 申请(专利权)人: 新疆农业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 代理人: 董芙蓉
地址: 830052 新疆维吾尔自*** 国省代码: 新疆;65
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摘要:
搜索关键词: fshr 基因 特异 snp 标记 吐鲁番 黑羊产羔数 性状 检测 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种FSHR基因特异SNP标记,其特征在于,所述SNP标记来源于吐鲁番黑羊FSHR基因,所述SNP标记位于吐鲁番黑羊第3号染色体上第75320741位,原始碱基为C,变异碱基为T;所述SNP标记所在的核苷酸序列为SEQ ID NO.1;

所述SNP位点的TT基因型个体的产羔数显著高于CC基因型个体的产羔数。

2.一种用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物,其特征在于,所述引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.2-4。

3.一种用于检测权利要求1所述SNP标记的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求2所述的引物。

4.权利要求2所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在吐鲁番黑羊产羔数选育性状中的应用。

5.一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述方法包括:通过对待测黑羊基因中SNP标记进行检测来确定所述黑羊的产羔数性状;其中,所述SNP标记为权利要求1所述的SNP标记。

6.如权利要求5所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

提取待测吐鲁番黑羊的基因组DNA;

以所述DNA为扩增模板,以权利要求2所述的引物为扩增引物,进行竞争性等位基因特异性PCR分型,获得PCR分型结果CC型、CT型和TT型,根据分型结果确定SNP标记的所有基因型,根据所述基因型来判断所述待测吐鲁番黑羊的产羔数性状。

7.如权利要求6所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述SNP的基因型中,TT基因型个体的产羔数极显著高于CC基因型个体的产羔数。

8.如权利要求6所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述PCR的反应条件:95℃预变性10min,95℃变性20s、循环10次,61-55℃延伸1min,95℃变性20s、循环26次,55℃延伸1min;

所述PCR的反应体系:

2×Master Mix 2.5μL,

上游引物1 0.07μL,

上游引物2 0.07μL,

下游引物1 0.07μL,

DNA模板 30-50μg,

加水至总体积 5μL;

所述上游引物1的核苷酸序列为SEQ ID NO.2;

所述上游引物2的核苷酸序列为SEQ ID NO.3;

所述下游引物1的核苷酸序列为SEQ ID NO.4。

9.权利要求1所述的SNP标记作为检测靶标在鉴定或筛选吐鲁番黑羊中的应用,其特征在于,选择所述SNP标记中基因型为TT的个体,选育出产羔数多的吐鲁番黑羊品种。

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