[发明专利]FSHR基因特异SNP标记、吐鲁番黑羊产羔数性状的检测方法及其应用有效
申请号: | 201910130965.5 | 申请日: | 2019-02-20 |
公开(公告)号: | CN109735633B | 公开(公告)日: | 2022-04-26 |
发明(设计)人: | 刘武军;马海玉;方超;刘玲玲;王琼;曹行;吕士鹏;于茜;黄开飞;蒋芳芳 | 申请(专利权)人: | 新疆农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 董芙蓉 |
地址: | 830052 新疆维吾尔自*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | fshr 基因 特异 snp 标记 吐鲁番 黑羊产羔数 性状 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种FSHR基因特异SNP标记,其特征在于,所述SNP标记来源于吐鲁番黑羊FSHR基因,所述SNP标记位于吐鲁番黑羊第3号染色体上第75320741位,原始碱基为C,变异碱基为T;所述SNP标记所在的核苷酸序列为SEQ ID NO.1;
所述SNP位点的TT基因型个体的产羔数显著高于CC基因型个体的产羔数。
2.一种用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物,其特征在于,所述引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.2-4。
3.一种用于检测权利要求1所述SNP标记的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求2所述的引物。
4.权利要求2所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在吐鲁番黑羊产羔数选育性状中的应用。
5.一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述方法包括:通过对待测黑羊基因中SNP标记进行检测来确定所述黑羊的产羔数性状;其中,所述SNP标记为权利要求1所述的SNP标记。
6.如权利要求5所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
提取待测吐鲁番黑羊的基因组DNA;
以所述DNA为扩增模板,以权利要求2所述的引物为扩增引物,进行竞争性等位基因特异性PCR分型,获得PCR分型结果CC型、CT型和TT型,根据分型结果确定SNP标记的所有基因型,根据所述基因型来判断所述待测吐鲁番黑羊的产羔数性状。
7.如权利要求6所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述SNP的基因型中,TT基因型个体的产羔数极显著高于CC基因型个体的产羔数。
8.如权利要求6所述的一种检测吐鲁番黑羊产羔数性状的方法,其特征在于,所述PCR的反应条件:95℃预变性10min,95℃变性20s、循环10次,61-55℃延伸1min,95℃变性20s、循环26次,55℃延伸1min;
所述PCR的反应体系:
2×Master Mix 2.5μL,
上游引物1 0.07μL,
上游引物2 0.07μL,
下游引物1 0.07μL,
DNA模板 30-50μg,
加水至总体积 5μL;
所述上游引物1的核苷酸序列为SEQ ID NO.2;
所述上游引物2的核苷酸序列为SEQ ID NO.3;
所述下游引物1的核苷酸序列为SEQ ID NO.4。
9.权利要求1所述的SNP标记作为检测靶标在鉴定或筛选吐鲁番黑羊中的应用,其特征在于,选择所述SNP标记中基因型为TT的个体,选育出产羔数多的吐鲁番黑羊品种。
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