[发明专利]一种代谢物组与微生物组的数据相关分析系统及方法在审
申请号: | 201910138592.6 | 申请日: | 2019-02-25 |
公开(公告)号: | CN109817282A | 公开(公告)日: | 2019-05-28 |
发明(设计)人: | 贾伟;陈天璐;梁丹丹;赵爱华;郑晓皎;刘佳健 | 申请(专利权)人: | 上海市第六人民医院 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 俞涤炯 |
地址: | 200233 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 原始数据 微生物组 代谢组 数据处理模块 分析模块 分析系统 数据文件 数据相关 向量 组学 服务器 分析 服务器连接 准确度 变量数据 代谢物组 分析数据 结构要求 科学问题 生成模块 生成数据 数据整合 代谢物 和向量 微生物 数据库 参考 保存 | ||
1.一种代谢物组与微生物组的数据相关分析系统,其特征在于,包括一服务器,所述服务器连接一多组学数据库,所述多组学数据库用于保存代谢物组原始数据、微生物组原始数据和协变量数据;
所述服务器具体包括:
第一数据处理模块,用于获取所述代谢物组原始数据并处理得到代谢物数据文件,所述代谢物数据文件包括以行列形式排布的多个代谢物变量;
第二数据处理模块,用于获取所述微生物组原始数据并处理得到微生物数据文件,所述微生物数据文件包括以行列形式排布的多个微生物变量;
数据获取模块,用于于所述多组学数据库中获取所述协变量数据;
待分析数据生成模块,分别连接所述第一数据处理模块和所述第二处理模块,以及导入多组学数据库中的协变量数据,所述待分析数据生成模块具体包括:
指令接收单元,用于接收外部的控制指令并输出,所述控制指令包括单维相关分析指令和多维相关分析指令;
数据对生成单元,连接所述指令接收单元,用于根据所述单维相关分析指令,将各所述代谢物变量与各所述微生物变量加入一变量集合,并将所述变量集合中的各变量进行两两组合生成多个数据对;
数据降维单元,连接所述指令接收单元,用于根据所述多维相关分析指令,将所述代谢物数据文件进行降维处理得到代谢物特征向量文件和将所述微生物数据文件进行降维处理得到微生物特征向量文件,所述代谢物特征向量文件包括至少一个代谢物特征向量,所述微生物特征向量文件中包括至少一个微生物特征向量;
向量对生成单元,连接所述数据降维单元,用于将各所述代谢物特征向量和各所述微生物特征向量加入一向量集合,并将所述向量集合中的各特征向量进行两两组合生成多个向量对;
第一相关分析模块,分别连接所述待分析数据生成模块和所述数据获取模块,用于结合所述协变量数据对各所述数据对进行相关分析得到各所述数据对的相关关系和对应的相关性参数;
第二相关分析模块,分别连接所述待分析数据生成模块和所述数据获取模块,用于结合所述协变量数据对各所述向量对进行相关分析得到所述向量对的相关关系和对应的相关性参数;
所述数据相关分析系统的输出结果包括各所述数据对的相关关系和对应的相关性参数,以及各所述向量对的相关关系和对应的相关性参数。
2.根据权利要求1所述的数据相关分析系统,其特征在于,所述服务器还包括网络分析模块,连接所述第一相关分析模块,所述网络分析模块具体包括:
可视化单元,用于获取各所述数据对的相关关系及对应的相关性参数,并根据所述相关关系和所述相关性参数生成相关性网络图;
节点统计单元,连接所述可视化单元,用于按照预设规则对所述相关性网络图中的各节点进行重要性排序并生成重要性排序表;
所述数据相关分析系统的输出结果还包括所述相关性网络图和所述重要性排序表。
3.根据权利要求1所述的数据相关分析系统,其特征在于,
所述代谢物组原始数据和所述微生物组原始数据均按照预设格式形成;
所述预设格式为矩阵格式或者数据表格格式。
4.根据权利要求1所述的数据相关分析系统,其特征在于,所述第一数据处理模块对所述代谢物组原始数据进行处理的方式包括基线调整,和/或数据转换,和/或缺失值填充,和/或数据归一化。
5.根据权利要求1所述的数据相关分析系统,其特征在于,所述第二数据处理模块对所述微生物组原始数据进行处理的方式包括零值替换,和/或中心转换,和/或额外转换,和/或数据归一化。
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