[发明专利]一种病理组织切片高光谱图像的特征提取方法有效
申请号: | 201910167723.3 | 申请日: | 2019-03-06 |
公开(公告)号: | CN110008836B | 公开(公告)日: | 2023-04-25 |
发明(设计)人: | 周梅;吴华健;刘茜;李庆利 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | G06V20/69 | 分类号: | G06V20/69;G06V10/58 |
代理公司: | 上海蓝迪专利商标事务所(普通合伙) 31215 | 代理人: | 徐筱梅;张翔 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 病理 组织 切片 光谱 图像 特征 提取 方法 | ||
1.一种病理组织切片高光谱图像的特征提取方法,其特征在于,该方法包括以下具体步骤:
(1)分别读取m个同种病理组织切片的高光谱图像,采用光谱校正处理方法对m个同种病理组织切片的高光谱图像进行预处理;
(2)分别对预处理后的m个同种病理组织切片的高光谱图像采用多元曲线分辨-交替最小二乘方法分解,得到m组有序纯净光谱矩阵Moi(i=1,…,m)与对应的浓度分布矩阵;
(3)利用所述m组有序纯净光谱矩阵Moi(i=1,…,m)计算参考纯净光谱矩阵Mr,并从所述参考纯净光谱矩阵Mr中提取病变组织的参考纯净光谱SPu;
(4)采用所述参考纯净光谱矩阵Mr优化多元曲线分辨-交替最小二乘方法中的初始纯净光谱矩阵,对同种病理组织切片高光谱图像进行分解,获得纯净光谱矩阵Mn×λ(x1,x2,…,xn)T和浓度分布矩阵C1;
(5)根据所述的病变组织的参考纯净光谱SPu自动选取步骤(4)中所述浓度分布矩阵C1中病变组织对应的浓度分布矩阵。
2.根据权利要求1所述的病理组织切片高光谱图像的特征提取方法,其特征在于,所述步骤(2)具体包括:
①对预处理后的m个病理组织切片的高光谱图像I’i(x,y,λ),0i≤m;从三维矩阵转化成二维矩阵D*z×λ;D*z×λ为包含所有像素光谱的高光谱数据矩阵,每一行为一个像素点的光谱,z为图像的像素个数:
z=x×y
②多元曲线分辨-交替最小二乘算法表示为:
D*=C·M+E
将D*采用多元曲线分辨-交替最小二乘算法进行分解,得到纯净光谱矩阵Mn×λ以及与纯净光谱对应的浓度分布向量矩阵Cz×n,纯净光谱矩阵的n行分别代表n个组织成分的纯净光谱,浓度分布向量矩阵n列代表n个纯净光谱对应的浓度分布向量;E是残差值矩阵;
③将浓度分布向量矩阵Cz×n还原成浓度分布矩阵C1x×y×n,矩阵C1的n页代表了n个组织成分的浓度分布矩阵,根据先验知识,将浓度分布矩阵C1按成分重新排序得到有序浓度分布矩阵C2x×y×n,其中,C2x×y×n第一页是病变组织浓度分布矩阵;
同时根据浓度分布矩阵排序规律,将纯净光谱矩阵进行对应的排序得到有序纯净光谱矩阵Mon×λ,此时Mon×λ的第一行为病变组织的纯净光谱;
④分别对m个同种病理组织切片的高光谱图像进行步骤①-③,最终得到m个有序的纯净光谱矩阵Moi(i=1,…,m)。
3.根据权利要求1所述的病理组织切片高光谱图像的特征提取方法,其特征在于,所述步骤(3)具体包括:
①对得到的m个有序纯净光谱矩阵Moi(i=1,…,m)进行平均运算得到1个参考纯净光谱矩阵Mrn×λ:
将参考纯净光谱矩阵初始化多元曲线分辨-交替最小二乘方法中的初始纯净光谱矩阵;
②提取所述参考纯净光谱矩阵Mr的第一行光谱作为病变组织的参考纯净光谱SPu。
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