[发明专利]44个人类Y染色体基因座的复合扩增试剂盒及其应用

说明书

本发明涉及44个人类Y染色体基因座的复合扩增试剂盒及其应用。本发明提供一种人类Y染色体44个基因座的复合扩增体系，包括用于扩增44个基因座的特异性引物，所述44个基因座包括41个Y染色体STR基因座和3个Y染色体Indel。利用六色荧光标记技术对44对特异性引物进行分组荧光标记，通过引物序列和工作浓度的设计和优化，实现了44个人类Y染色体基因座的同时高效、特异、灵敏扩增。该复合扩增体系的检测结果具有很高的个体识别能力，且具有良好的数据兼容性，进而在实践上可以用于亲子鉴定和个体识别，有效降低了人类DNA分型的检测成本，提高了检测的工作效率。

技术领域

本发明涉及分子遗传学和生物检测技术领域，具体涉及44个人类Y染色体基因座的复合扩增试剂盒及其应用。

背景技术

短串联重复序列基因座(Short Tandem Repeat，STR)是目前普遍应用的遗传标记，其广泛存在于原核及真核生物基因组中，是一类由2～6个核苷酸为重复单元组成的几十至一百多个的核苷酸重复序列。不同数目的核心序列呈串联重复排列，而长度呈现多态性。根据两端保守性序列，设计引物进行PCR，然后通过聚丙烯酰胺、琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳等可以检测STR遗传标记的多态性。STR标记与其他遗传标记物相比，STR基因座片段小、容易扩增，更适用于微量和降解检材，各基因座的扩增条件相近而能够复合扩增，因而具有快速、高效、准确、灵敏、信息量大等优点，尤其在建立DNA数据库方面，与以往RFLP等技术相比，STR复合扩增技术具有极大的优越性。

Y染色体STR遗传标记是指存在于人类Y染色体非重组区域的短串联重复序列。目前，以各种形式确认并命名的Y-STR基因座已有220多个，将已发现的Y染色体STR遗传标记与常染色体STR遗传标记相比，大多数Y染色体STR遗传标记具有复杂重复结构，含有两种或两种以上的不同重复单位，群体中个体的核心重复序列或重复次数不同，形成群体遗传多态性。Y染色体STR遗传标记具有男性特有、父系遗传及单倍型遗传等三大特征，将其独特性与STR位点分型检测的优越性相结合，可进行法医学个体识别、亲子鉴定及DNA家谱构建等。

随着国内STR人类身份识别试剂盒和DNA数据库建库工程的发展和Y-STR数据库建设市场的扩大，亟需一个的个体识别率更高，检测基因座数更多、兼容性更好的试剂盒。利用五色荧光检测技术的Y STR试剂盒已无法满足目前市场的需求，六色荧光检测技术的建立、应用和改进，能够更好地满足STR基因座荧光检测试剂盒的需要。因此，Y-STR数据库建设领域亟需开发能够实现一个反应同时扩增更多基因座、能提供更多信息量、具有更好兼容性和更快扩增速度的基因座扩增体系。

发明内容

为解决现有技术中存在的复合扩增同时检测的STR基因座的数量限制、试剂盒的兼容性差等技术问题，本发明提供一种能够同时检测44个染色体基因座的复合扩增试剂盒及其应用。

一方面，本发明提供一种用于人类Y染色体DNA分型的基因座分子标记，其特征在于，所述分子标记包括如下44个基因座：41个Y染色体STR基因座：DYS456、DYS549、DYS439、DYS19、DYS392、DYS643、DYS447、DYS557、DYS391、DYS388、DYS570、DYS635、DYS448、DYS437、DYS527a、DYS527b、DYS444、DYS393、DYS389I、DYS390、DYS389II、DYS438、DYS576、DYS645、DYF404S1a、DYF404S1b、DYS460、DYS458、DYS481、DYS385a、DYS385b、DYS449、DYS596、Y_GATA_H4、DYS533、DYS627、DYS518、DYF387S1a、DYF387S1b、DYS593、DYS522；3个Y染色体Indel：rs199815934、rs771783753、rs759551978。

另一方面，本发明提供一种人类Y染色体44个基因座的复合扩增试剂盒，其包括所述的44个基因座的扩增引物。