[发明专利]一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的引物、探针及检测方法在审
申请号: | 201910178012.6 | 申请日: | 2019-03-07 |
公开(公告)号: | CN109735642A | 公开(公告)日: | 2019-05-10 |
发明(设计)人: | 戴洋;倪碧娴;曹俊;王晓婷;羊海涛;郭利川;刘燕红;王智宏;应清界 | 申请(专利权)人: | 江苏省血吸虫病防治研究所;江苏奇天基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 李冉 |
地址: | 214064 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 灵敏度 荧光法检测 探针 引物 反应检测 特异性强 高通量 | ||
1.一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的引物,其特征在于,所述引物序列如下:
上游引物:5’-TCAGGAAGGAGGCCCTCAAGAGCCTGAACG-3’;SEQ ID NO.3;
下游引物:5’-AGCTTCGTGTTTGTGAGCGCTTCTGTCGTG-3’;SEQ ID NO.5。
2.根据权利要求1所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的引物,其特征在于,所述上游引物和下游引物的使用浓度为5~20μM。
3.根据权利要求2所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的引物,其特征在于,所述上游引物和下游引物的使用浓度为10μM。
4.一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的探针,其特征在于,所述探针序列如下:
5’-TYGCCACGGAGAACGCMGARAGGAAGAAGATGTAYGACCAGCTCAACG-3’;SEQ ID NO.8;
所述探针采用荧光报告基团和荧光淬灭基团进行修饰,荧光报告基团修饰在探针序列离5’端碱基数31bp的位置上;荧光淬灭基团修饰在探针序列离5’端碱基数33bp的位置上,荧光报告基团与淬灭基团之间间隔1个碱基G,其中离5’端碱基数32bp的位置上的G用四氢呋喃残基替换。
5.根据权利要求4所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的探针,其特征在于,所述荧光报告基团为FAM、HEX、TET、JOE或VIC;所述荧光淬灭基团为BHQ1、BHQ2或BHQ3。
6.根据权利要求5所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的探针,其特征在于,所述荧光报告基团为FAM;所述荧光淬灭基团为BHQ1。
7.根据权利要求4-6任一项所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的探针,其特征在于,所述探针的浓度为5~40μM。
8.根据权利要求7所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的探针,其特征在于,所述探针的浓度为10μM。
9.一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)提取待检样本DNA,获得DNA提取液;
(2)将恒温荧光基因检测仪接通电源进行预热,对反应参数进行设置;
(3)在42.5μL反应缓冲液中加入浓度为10μM的2μL引物和0.5μL探针,充分混合后添加到RAA荧光基础反应试剂中混合,得到反应预混液;
(4)将5μL所述步骤(1)中得到的DNA提取液与所述步骤(3)中得到的反应预混液充分混合,得到的反应体系放入恒温荧光基因检测仪检测荧光信号;
(5)根据检测仪器中的阳性判定方法,将斜率值K≥20时,判定为阳性;斜率值K<20时判定为阴性。
10.根据权利要求9所述的一种RAA荧光法检测蓝氏贾第鞭毛虫的方法,其特征在于,所述反应参数设置为39℃,反应时间:15min。
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