[发明专利]鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用有效
申请号: | 201910186568.X | 申请日: | 2019-03-12 |
公开(公告)号: | CN109706266B | 公开(公告)日: | 2022-04-01 |
发明(设计)人: | 魏大勇;汤青林;李晟男;王志敏;钱伟 | 申请(专利权)人: | 西南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙) 51220 | 代理人: | 李英 |
地址: | 400000*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 甘蓝 表皮 有无 分子 标记 及其 开发 方法 应用 | ||
1.鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
2.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02的开发方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)以一份无毛甘蓝与一份有毛野生甘蓝B.incana杂交产生F1代,F1代自交获得F2代植株,根据F2代植株中无毛和有毛性状的分离比例,判定控制该野生甘蓝的表皮毛性状的基因类型;
2)利用F2代植株中的无性系F2群体构建甘蓝遗传连锁图谱,并将表皮毛基因定位到甘蓝C01染色体上一段4.3cM的区间;
3)从F2群体中挑选相同数目的无表皮毛和有表皮毛的植株,对亲本和极端混池进行全基因组重测序,根据Takagi等方法,采用Δ(SNP-index)法鉴定与甘蓝表皮毛性状显著相关的差异热点区域,同时结合上述QTL定位结果,最后将甘蓝表皮毛性状定位在甘蓝C01染色体上1.04Mb的区间内;
4)通过与拟南芥的同源比对和基因注释信息,在上述区间内发现一个候选基因BolTRY-l,该基因与拟南芥调控表皮毛基因AthTRY具有类似功能,qRT-PCR分析显示,F2群体中候选基因BolTRY-l在无毛植株的表达量显著高于有毛植株;
5)进一步克隆有毛甘蓝和无毛甘蓝BolTRY-l基因的CDS,序列比对发现,二者的CDS序列存在SNP。
3.表皮毛有无的甘蓝品种鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)以待鉴定甘蓝DNA为模板,扩增分子标记,引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQID No.3所示;
(2)扩增产物利用限制性酶HinfI进行酶切,酶切后进行凝胶电泳,获得271-bp、185-bp、158-bp、131-bp和27-bp五种特异条带;
(3)出现271-bp、158-bp、131-bp和27-bp四种特异条带的甘蓝植株,为纯合的有毛个体,出现271-bp、185-bp和131-bp三种条带的,为纯合的无毛植株,同时出现五种特异条带的为杂合个体。
4.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02在甘蓝表皮毛有无的遗传育种中的用途。
5.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02在选育表皮毛有无的甘蓝品种中的用途。
6.如权利要求3所述的甘蓝品种鉴定方法在甘蓝表皮毛有无的遗传育种中的用途。
7.如权利要求3所述的甘蓝品种鉴定方法在选育表皮毛有无的甘蓝品种中的用途。
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