[发明专利]鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用有效

专利信息
申请号: 201910186568.X 申请日: 2019-03-12
公开(公告)号: CN109706266B 公开(公告)日: 2022-04-01
发明(设计)人: 魏大勇;汤青林;李晟男;王志敏;钱伟 申请(专利权)人: 西南大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 成都行之专利代理事务所(普通合伙) 51220 代理人: 李英
地址: 400000*** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 鉴定 甘蓝 表皮 有无 分子 标记 及其 开发 方法 应用
【权利要求书】:

1.鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。

2.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02的开发方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)以一份无毛甘蓝与一份有毛野生甘蓝B.incana杂交产生F1代,F1代自交获得F2代植株,根据F2代植株中无毛和有毛性状的分离比例,判定控制该野生甘蓝的表皮毛性状的基因类型;

2)利用F2代植株中的无性系F2群体构建甘蓝遗传连锁图谱,并将表皮毛基因定位到甘蓝C01染色体上一段4.3cM的区间;

3)从F2群体中挑选相同数目的无表皮毛和有表皮毛的植株,对亲本和极端混池进行全基因组重测序,根据Takagi等方法,采用Δ(SNP-index)法鉴定与甘蓝表皮毛性状显著相关的差异热点区域,同时结合上述QTL定位结果,最后将甘蓝表皮毛性状定位在甘蓝C01染色体上1.04Mb的区间内;

4)通过与拟南芥的同源比对和基因注释信息,在上述区间内发现一个候选基因BolTRY-l,该基因与拟南芥调控表皮毛基因AthTRY具有类似功能,qRT-PCR分析显示,F2群体中候选基因BolTRY-l在无毛植株的表达量显著高于有毛植株;

5)进一步克隆有毛甘蓝和无毛甘蓝BolTRY-l基因的CDS,序列比对发现,二者的CDS序列存在SNP。

3.表皮毛有无的甘蓝品种鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)以待鉴定甘蓝DNA为模板,扩增分子标记,引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQID No.3所示;

(2)扩增产物利用限制性酶HinfI进行酶切,酶切后进行凝胶电泳,获得271-bp、185-bp、158-bp、131-bp和27-bp五种特异条带;

(3)出现271-bp、158-bp、131-bp和27-bp四种特异条带的甘蓝植株,为纯合的有毛个体,出现271-bp、185-bp和131-bp三种条带的,为纯合的无毛植株,同时出现五种特异条带的为杂合个体。

4.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02在甘蓝表皮毛有无的遗传育种中的用途。

5.如权利要求1所述的鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome-CAPS.02在选育表皮毛有无的甘蓝品种中的用途。

6.如权利要求3所述的甘蓝品种鉴定方法在甘蓝表皮毛有无的遗传育种中的用途。

7.如权利要求3所述的甘蓝品种鉴定方法在选育表皮毛有无的甘蓝品种中的用途。

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