[发明专利]黄麻中耐盐性状的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及植物育种技术领域，具体而言，涉及一种黄麻中耐盐性状的分子标记及其应用。其该SNP位点存在于黄麻基因组中，与影响黄麻耐盐性状的QTL连锁，因而能够用于黄麻耐盐性状的相关研究。本发明提供的SNP位点能够应用于黄麻耐盐品种的培育中，还可以用于种群遗传结构和遗传变异水平等方面的研究。

技术领域

本发明涉及植物育种技术领域，具体而言，涉及一种黄麻中耐盐性状的分子标记及其应用。

背景技术

土壤盐渍化已经演变为一个全球性问题，是导致土地荒漠化和耕地退化的重要因素之一，也已成为人类面临的重大危机。土壤盐渍化问题严重影响了植物的生长和发育，已经成为自然界主要的非生物胁迫之一。目前，全球盐碱地面积已达9.5亿hm2。土壤盐渍化已成为制约粮食生产和影响粮食安全的重要因素。然而人口的快速增长与粮食短缺的矛盾日益加重，通过筛选和培育耐盐作物新品种的方法来改良、利用盐碱地，被认为是一种具有经济和生态双重效益的解决方案。

黄麻为椴树科(Tiliaceae)，黄麻属(Corchorus)植物，一年生草本韧皮纤维作物，目前世界上主栽的黄麻主要有两种，即圆果种黄麻(Corchorus. capsularis，南亚的印度、孟加拉、尼泊尔等国称为white jute)和长果种黄麻(Corchorus. olitorius，南亚称为tossa jute)。

黄麻是世界上最重要的韧皮纤维作物之一，其纤维吸湿性好，散水快，具有抗菌抑菌、可降解和环境友好等特性，在商业上拥有“金色纤维”的美称，是麻纺工业的重要原料，在世界上黄麻产量与种植面积仅次于棉花。黄麻又是一种重要的耐盐经济作物，它能够在沿海滩涂、盐碱土地大面积种植。

目前，黄麻耐盐性研究进展缓慢，人们对黄麻耐盐性方面的认识还处于初始阶段，有关黄麻耐盐性分子机制的报道较少，前人对黄麻耐盐性的报道也相对较少。总体来说黄麻分子生物学基础比较薄弱。分析黄麻在盐胁迫下的基因表达变化，寻找黄麻盐胁迫响应基因，并对其进行功能预测及代谢通路分析，加深对黄麻耐盐机理研究，这将有利于培育黄麻优良耐盐品种，对其他植物耐盐性的研究也具有重要意义。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明涉及一种新颖的与黄麻耐盐性状有关的SNP位点，并对该SNP位点的检测、应用等方面进行研究。

该SNP位点存在于黄麻基因组中，与影响黄麻耐盐性状的QTL连锁，因而能够用于黄麻耐盐性状的相关研究。

采用该SNP位点能够用于耐盐抗性的黄麻植物的培育和鉴定。

与现有技术相比，本发明的有益效果为：

本发明提供的mk6160 SNP、mk5633 SNP、mk6484 SNP、mk6723 SNP、mk7047 SNP、mk5945、mk6330、mk6391、mk6398能够应用于黄麻耐盐品种的培育中，还可以用于种群遗传结构和遗传变异水平等方面的研究。

附图说明

为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本发明的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。

图1为本发明实施例中所采用的GBS 技术路线示意图；

图2为本发明实施例中遗传图谱信息分析内容的流程示意图；

图3为本发明实施例中GBS文库构建流程示意图；

图4为本发明实施例中150个F_2：3 lines的STIG和两个盐胁迫条件（图4A：140mM盐浓度；图4B：160mM盐浓度）下处理第四天的STIG数据显示正态分布；