[发明专利]一种基于深度学习的肝脏CT图像分割方法有效
申请号: | 201910203733.8 | 申请日: | 2019-03-18 |
公开(公告)号: | CN109949309B | 公开(公告)日: | 2022-02-11 |
发明(设计)人: | 刘荣;王宜主;王斐;王子政;张勇;王翊 | 申请(专利权)人: | 安徽紫薇帝星数字科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06T5/00;G06N3/08;G06T3/40;G06N3/04 |
代理公司: | 合肥英特力知识产权代理事务所(普通合伙) 34189 | 代理人: | 李伟 |
地址: | 230000 安徽省合肥市高新区*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 肝脏 ct 图像 分割 方法 | ||
本发明公开了一种基于深度学习的肝脏CT图像分割模型建立方法,包括以下步骤:1.收集腹部CT图像,并对肝脏位置进行标注,生成原始图像序列,然后将原始图像序列分为训练样本和测试样本;2.对训练样本进行预处理,同时去除干扰信息;3.搭建肝脏分割深度学习网络;4.利用搭建完成的学习网络对预处理后的训练样本进行模型训练,得到肝脏分割模型;5.对测试样本进行预处理,并作为输入参数输入到肝脏分割模型,得到初分割图像,然后对每套图像进行连通域处理,连通域处理后的分割结果反馈至原始图像序列中。基于该肝脏CT图像分割模型,可以直接对预处理后的肝脏CT图像进行准确地分割,分割结果准确率高,细节刻画效果好。
技术领域
本发明涉及医学图像处理技术领域,尤其是一种基于深度学习的肝脏CT图 像分割模型建立方法以及基于该分割模型的肝脏CT图像分割方法。
背景技术
肝脏的准确分割是肝脏三维可视化及计算机辅助诊断的重要步骤,同时也 能为其他器官(如胰腺、脾脏、肾脏等)的分割提供指导意见。针对肝脏的分 割,专业学者提出了多种方法,例如基于区域的分割、基于边缘的分割、基于 形态的分割等,但这些分割方法对图像的特征提取能力不足,分割效果有待提 高。
近年来,随着深度学习的快速发展,深度学习在传统计算机视觉方面取得 了不少突破性进展。在定位、分类、实例分割等任务中,深度学习的方法已经 能够接近人类水平,有的甚至已经超越人类水平。这些技术的发展也在一定程 度上促进了深度学习在医学图像处理技术邻域的探究,例如疾病的诊断、器官 的分割等。
目前,在医学上应用的模型大多是FCN、U-Net结构以及它们的变形。在这 些结构中,层与层之间通过简单的堆叠进行特征传递,导致特征信息的利用率 较低,池化层的应用导致一些信息丢失,同时缺少有效的特征整合。这些问题 在边缘以及一些小目标分割中具有重要的影响。由于GPU的显存限制,以及损 失函数的梯度消失效应,很难构建较深的卷积神经网络,无法很好地利用深层 卷积带来处理效果的提升。
发明内容
针对上述问题,本发明提供一种基于深度学习的肝脏CT图像分割模型建立 方法以及基于该分割模型的肝脏CT图像分割方法。
本发明保护一种基于深度学习的肝脏CT图像分割模型建立方法,包括以下 步骤:1.收集大量患者的腹部CT图像,并对肝脏位置进行标注,生成原始图像 序列,然后将原始图像序列分为训练样本和测试样本;2.对训练样本进行预处 理,同时去除干扰信息;3.搭建基于Encoder-Decoder模型的肝脏分割深度学 习网络,其中Encoder阶段利用带残差结构的深度可分离卷积对CT图像进行特 征提取,Decoder阶段通过逐步的上采样将特征图恢复到原始图像大小并对图像 中每一个像素点进行分类;4.利用搭建完成的学习网络对预处理后的训练样本 进行模型训练,得到肝脏分割模型;5.对测试样本进行预处理,并作为输入参 数输入到肝脏分割模型,得到初分割图像,然后对每套图像进行连通域处理, 连通域处理后的分割结果反馈至原始图像序列中。
进一步的,所述Encoder阶段先将CT图像大小缩小16倍以提取其特征信 息,然后将特征信息传递到特征金字塔模块进行特征融合,再进入所述Decoder 阶段,通过4次上采样将特征图扩大16倍以恢复至原始大小;所述特征金字塔 模块内部采用3×3空洞卷积。更进一步的,所述Encoder阶段先采用步长为2 的7×7的卷积进行CT图像特征的提取,后接BN层和ReLU层;然后再利用带 有残差结构的深度可分离卷积模块对CT图像进行特征提取;同时利用步长为2 的卷积与平均池化相结合的方式进行池化操作;所述Decoder阶段上采样的过 程中,先将底层信息与高层信息进行融合,然后采用转置卷积进行上采样。
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