[发明专利]一种无监督的腹部CT序列图像多器官同时自动分割方法有效
申请号: | 201910211823.1 | 申请日: | 2019-03-20 |
公开(公告)号: | CN109934235B | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 赵于前;唐萍;廖苗;杨振;廖胜辉 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | G06K9/34 | 分类号: | G06K9/34;G06K9/62;G06T5/00;G06T7/11 |
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地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 监督 腹部 ct 序列 图像 器官 同时 自动 分割 方法 | ||
1.一种无监督的腹部CT序列图像多器官同时自动分割方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)脊椎和肋骨去除及图像裁剪,具体包括以下步骤:
a.采用指数变换方法y=ex-1对输入CT图像进行对比度拉伸,增强脊椎、肋骨与软组织的对比度,其中,x为输入图像灰度,y为指数变换后的图像灰度;
b.对指数变换后的CT图像采用OTSU算法与形态学运算提取出脊椎和肋骨,并将其从输入CT图像中去除;
c.根据脊椎和肋骨外围的最小包围盒裁剪脊椎和肋骨被去除后的CT图像,得到裁剪后的CT图像;
(2)目标器官初分割,生成目标器官的初始轮廓,具体包括以下步骤:
a.对步骤(1)所得裁剪后的CT序列进行超体素分割,得到超体素集合S={S1,S2,…,SN},其中,N为超体素数目;对每一超体素,计算其灰度直方图特征,得到高维特征集合Q={Q1,Q2,…,QN},其中,Qi:Kd为直方图的通道数目,即高维空间的维度;
b.采用局部线性嵌入算法对每个超体素Si的高维特征Qi进行非线性降维:首先寻找高维空间中与样本点Qi的几何距离及特征距离最近的R个样本点作为Qi的近邻点;然后,计算每个近邻点Qj对样本点Qi的线性重构系数Wij:
其中,α为正则化参数;对于不在样本点Qi邻域内的其他样本点z=R+1,R+2,…,N;Wiz=0;最后,构建局部线性误差能量函数:
其中,I为单位矩阵,为高维空间样本点Qi在低维空间的嵌入,d为低维空间的维度;通过矩阵化及拉格朗日乘子法最小化该能量函数,得到低维特征矩阵矩阵中每一行对应一个超体素,每一列对应超体素的一个低维特征;
c.采用K-Means算法将特征矩阵Y聚成KC类,生成目标器官,即肝脏、脾脏、左肾、右肾的候选区域,其中,KC为聚类数目;
d.基于灰度、体积、相对位置解剖学先验,从上述候选区域中识别出肝脏、脾脏、左肾、右肾,实现目标器官初分割,得到目标器官初分割结果;
(3)对目标器官初分割结果进行优化,实现目标器官终分割,具体包括以下步骤:
a.首先根据目标器官初分割结果,采用粒计算分别获取肝脏、脾脏、肾脏的灰度范围和并分别构建肝脏灰度模型,脾脏灰度模型,以及肾脏灰度模型:
和
然后计算各灰度模型在每个灰度的最大值,构建混合灰度模型:
fcom(i)=max{fliv(i),fspl(i),fkid(i)};
最后根据该混合灰度模型对步骤(1)所得裁剪后的CT图像进行灰度映射,实现多器官同时增强,得到增强后的CT图像;其中k为控制目标与背景之间对比度的常数,i为图像灰度,和分别为肝脏、脾脏和肾脏灰度的最小值,和分别为肝脏、脾脏和肾脏灰度的最大值;
b.构建三维Chan-Vese模型能量函数,优化目标器官初始轮廓:
其中,前两项为数据项,第三项为平滑项,Ω为图像域,u0为步骤a所得增强后的CT图像,φ为水平集函数,其初始值为步骤(2)所得目标器官初分割结果,(x,y,z)为图像u0中体素的坐标,λ1、λ2和μ分别为控制数据项与平滑项的权重,cin和cout分别表示图像u0在水平集函数φ轮廓内、外的平均灰度值,H(·)、δ(·)和▽(·)分别为Heaviside函数、Dirac函数和梯度算子;通过Euler-Lagrange公式结合梯度下降法最小化该能量函数,获得多器官轮廓优化结果;
c.为解决由混合灰度模型导致的毗邻器官边界消失问题,首先在步骤(1)所得裁剪后的CT图像中定位两个毗邻器官初始轮廓的交界区域,以该区域为中心,选取大小为H×H×H的三维图像块作为ROI区域;然后通过直方图均衡算法增强该区域内不同器官/组织间的对比度,并利用中值滤波去除噪声,获得增强并平滑后的ROI区域;最后采用K-Means聚类算法将增强并平滑后的ROI区域内像素聚为KT类,并结合ROI区域内毗邻器官间的灰度关系,准确定位器官边界,实现毗邻器官分离。
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