[发明专利]一种用于核酸适配体筛选的试剂盒及其使用、检测方法在审

专利信息
申请号: 201910221173.9 申请日: 2019-03-22
公开(公告)号: CN110029110A 公开(公告)日: 2019-07-19
发明(设计)人: 罗昭锋;杨伟丽;方晓娜;王进军 申请(专利权)人: 安徽省昂普拓迈生物科技有限责任公司
主分类号: C12N15/115 分类号: C12N15/115;C12N15/10;C12Q1/6851
代理公司: 合肥市长远专利代理事务所(普通合伙) 34119 代理人: 段晓微
地址: 230000 安徽省合肥市经济技*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 筛选 核酸适配体 试剂盒 核酸文库 磁珠 荧光定量PCR 分子量标准 链霉亲和素 靶标结合 实验流程 磁珠法 短序列 生成油 微液滴 预混液 种检测 磁铁 多轮 修饰 制备 检测
【权利要求书】:

1.一种用于核酸适配体筛选的试剂盒,其特征在于,其原料包括:磁铁、链霉亲和素修饰磁珠、核酸文库、短序列、PCR预混液、ePCR微液滴生成油、荧光定量PCR预混液、分子量标准样;

其中,核酸文库为碱基个数为60-100个的单链DNA,由正向引物、随机序列和反向引物构成,其中,正向引物和反向引物的碱基个数均为18-22个;

短序列的3’端进行了生物素修饰,短序列与核酸文库的正向引物的碱基反向互补配对;

PCR预混液的原料包括:100μM的荧光修饰的核酸文库正向引物5μL,100μM的polyA修饰的核酸文库反向引物5μL,10mM的dNTP20μL,5U/μL的DNA聚合酶4μL,10×DNA聚合酶缓冲液100μL,加重蒸水至1000μL;

ePCR微液滴生成油包括:EM90 1.93g,Triton X-100 36.5mg,矿物油35.32g;

荧光定量PCR预混液的原料包括:100μM核酸文库的正向引物5μL,100μM核酸文库的反向引物5μL,10mM的dNTP20μL,5U/μL的DNA聚合酶4μL,10×DNA聚合酶缓冲液100μL,荧光染料,加重蒸水至1000μL。

2.根据权利要求1所述用于核酸适配体筛选的试剂盒,其特征在于,核酸文库的序列为5’-ATTGGCACTCCACGCATAGG-40N-CCTATGCGTGCTACCGTGAA-3’,其中,40N表示40个任意的核苷酸碱基连接而成的序列;优选地,短序列的序列为:5’-CCTATGCGTGGAGTGCCAAT-biotin-3’。

3.根据权利要求1或2所述用于核酸适配体筛选的试剂盒,其特征在于,荧光修饰的核酸文库正向引物为FAM修饰的核酸文库正向引物;优选地,FAM修饰的核酸文库正向引物的序列为5’-FAM-ATTGGCACTCCACGCATAGG;优选地,polyA修饰的核酸文库反向引物为5’-(20A)-Spacer18修饰的核酸文库反向引物;优选地,5’-(20A)-Spacer18修饰的核酸文库反向引物的序列为5’-(20A)-Spacer18-GGATACGCACGATGGCACTT;优选地,20A表示由20个腺苷酸组成的polyA尾,Spacer18表示18原子的六乙二醇间臂,Spacer18的结构式如式I所示:

4.根据权利要求1-3任一项所述用于核酸适配体筛选的试剂盒,其特征在于,荧光定量PCR预混液中,核酸文库的正向引物的序列为5’-ATTGGCACTCCACGCATAGG;优选地,荧光定量PCR预混液中,核酸文库的反向引物的序列为5’-GGATACGCACGATGGCACTT;优选地;链霉亲和素修饰磁珠的浓度为107-10个/μL;优选地,分子量标准样为安徽省昂普拓迈生物科技公司的小片段荧光单链DNA分子量标准,货号为SDL-100;优选地,荧光染料为能与DNA结合的荧光染料。

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