[发明专利]基于TdT-RCA的传感器及其在DNA甲基转移酶检测中的应用有效

专利信息
申请号: 201910222553.4 申请日: 2019-03-22
公开(公告)号: CN109750088B 公开(公告)日: 2022-06-21
发明(设计)人: 颜玉蓉;丁世家;程伟;晏小玉;马洪敏;阙海英;王通;刘萍;甘秀锋 申请(专利权)人: 重庆医科大学
主分类号: C12Q1/6825 分类号: C12Q1/6825;C12Q1/682
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 周建军
地址: 400016*** 国省代码: 重庆;50
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 基于 tdt rca 传感器 及其 dna 甲基转移酶 检测 中的 应用
【权利要求书】:

1.一种检测Dam甲基转移酶的荧光传感器,其特征在于,包括:反应溶液I、反应溶液II和反应溶液III;

所述反应溶液I包括:Dam甲基转移酶反应缓冲液、DpnI反应缓冲液、Dam甲基转移酶检测探针、S-腺苷甲硫氨酸(SAM)、DpnI、Dam甲基转移酶;

所述反应溶液II包括:末端转移酶及其反应缓冲液、dATP;

所述反应溶液III包括:dNTPs、Phi29DNA聚合酶及其反应缓冲液、哑铃状滚环模板、硫黄素T;

所述Dam甲基转移酶检测探针为具茎环结构的长度为38nt的第一DNA发夹探针,所述第一DNA发夹探针的茎部含5’-G-A-T-C-3’的回文序列,供Dam甲基转移酶特异性识别;所述检测探针3’末端使用氨基修饰;所述Dam甲基转移酶检测探针的序列如SEQ ID NO.1所示:

5’-AGAAGGATCTTATCGACTTGCTTAAGATCCTTCTTAAT-NH2-3’(SEQ ID NO.1);

所述哑铃状滚环模板由环部包含富T序列及富C序列的第二DNA发卡探针折叠成发夹结构,随后采用T4 DNA连接酶连接而成;所述第二DNA发卡探针5’端进行磷酸化修饰;所述第二DNA发卡探针长度为62nt,所述第二DNA发卡探针的序列如SEQ ID NO.2所示:

5’-P-ATTCGTAGACCCGCCCTACCCATCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATACGCTACGAAT -3’(SEQ ID NO.2)。

2.利用权利要求1所述荧光传感器检测Dam甲基转移酶的方法,其特征在于:

包括如下步骤:

(a)将待测样品加入反应溶液I中进行孵育反应,然后进行高温灭活处理;

(b)向步骤(a)高温灭活处理后的溶液中加入反应溶液II,进行末端转移酶催化的聚合反应;

(c)取步骤(b)所得聚合产物,加入反应溶液Ⅲ进行滚环扩增反应;

(d)对步骤(c)反应后的溶液进行荧光检测,实现对待测样品中Dam甲基转移酶的定量分析;

所述方法为非疾病诊断与治疗方法。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,所述待测样品与所述反应溶液I混合后,所得的混合液中包括:1×Dam甲基转移酶反应缓冲液、1×DpnI反应缓冲液、1μM Dam甲基转移酶检测探针、96~192μM SAM、1~6U DpnI、0.1~40U/mL Dam甲基转移酶。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,所述待测样品与所述反应溶液I混合后,所得的混合液中包括:1×Dam 甲基转移酶反应缓冲液、1×DpnI 反应缓冲液、1μM Dam 甲基转移酶检测探针、160~192μM SAM、4~6U DpnI和0.1~40U/mL的Dam甲基转移酶。

5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,孵育反应条件为:37℃,孵育时间为1h。

6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,高温灭活处理温度为80℃,灭活时间为20min。

7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,加入所述反应溶液II后,所得的混合液中包括:4~14U末端转移酶、0.5mM dATP、1x末端转移酶反应缓冲液。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,加入所述反应溶液II后,所得的混合液中包括:10~14U末端转移酶、0.5mM dATP、1x末端转移酶反应缓冲液。

9.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,聚合反应条件为:37℃,40min。

10.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,聚合反应后还包括高温灭活步骤,条件为75℃,10min。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于重庆医科大学,未经重庆医科大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910222553.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top