[发明专利]基于TdT-RCA的传感器及其在DNA甲基转移酶检测中的应用有效
申请号: | 201910222553.4 | 申请日: | 2019-03-22 |
公开(公告)号: | CN109750088B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 颜玉蓉;丁世家;程伟;晏小玉;马洪敏;阙海英;王通;刘萍;甘秀锋 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825;C12Q1/682 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 周建军 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 tdt rca 传感器 及其 dna 甲基转移酶 检测 中的 应用 | ||
1.一种检测Dam甲基转移酶的荧光传感器,其特征在于,包括:反应溶液I、反应溶液II和反应溶液III;
所述反应溶液I包括:Dam甲基转移酶反应缓冲液、DpnI反应缓冲液、Dam甲基转移酶检测探针、S-腺苷甲硫氨酸(SAM)、DpnI、Dam甲基转移酶;
所述反应溶液II包括:末端转移酶及其反应缓冲液、dATP;
所述反应溶液III包括:dNTPs、Phi29DNA聚合酶及其反应缓冲液、哑铃状滚环模板、硫黄素T;
所述Dam甲基转移酶检测探针为具茎环结构的长度为38nt的第一DNA发夹探针,所述第一DNA发夹探针的茎部含5’-G-A-T-C-3’的回文序列,供Dam甲基转移酶特异性识别;所述检测探针3’末端使用氨基修饰;所述Dam甲基转移酶检测探针的序列如SEQ ID NO.1所示:
5’-AGAAGGATCTTATCGACTTGCTTAAGATCCTTCTTAAT-NH2-3’(SEQ ID NO.1);
所述哑铃状滚环模板由环部包含富T序列及富C序列的第二DNA发卡探针折叠成发夹结构,随后采用T4 DNA连接酶连接而成;所述第二DNA发卡探针5’端进行磷酸化修饰;所述第二DNA发卡探针长度为62nt,所述第二DNA发卡探针的序列如SEQ ID NO.2所示:
5’-P-ATTCGTAGACCCGCCCTACCCATCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATACGCTACGAAT -3’(SEQ ID NO.2)。
2.利用权利要求1所述荧光传感器检测Dam甲基转移酶的方法,其特征在于:
包括如下步骤:
(a)将待测样品加入反应溶液I中进行孵育反应,然后进行高温灭活处理;
(b)向步骤(a)高温灭活处理后的溶液中加入反应溶液II,进行末端转移酶催化的聚合反应;
(c)取步骤(b)所得聚合产物,加入反应溶液Ⅲ进行滚环扩增反应;
(d)对步骤(c)反应后的溶液进行荧光检测,实现对待测样品中Dam甲基转移酶的定量分析;
所述方法为非疾病诊断与治疗方法。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,所述待测样品与所述反应溶液I混合后,所得的混合液中包括:1×Dam甲基转移酶反应缓冲液、1×DpnI反应缓冲液、1μM Dam甲基转移酶检测探针、96~192μM SAM、1~6U DpnI、0.1~40U/mL Dam甲基转移酶。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,所述待测样品与所述反应溶液I混合后,所得的混合液中包括:1×Dam 甲基转移酶反应缓冲液、1×DpnI 反应缓冲液、1μM Dam 甲基转移酶检测探针、160~192μM SAM、4~6U DpnI和0.1~40U/mL的Dam甲基转移酶。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,孵育反应条件为:37℃,孵育时间为1h。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(a)中,高温灭活处理温度为80℃,灭活时间为20min。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,加入所述反应溶液II后,所得的混合液中包括:4~14U末端转移酶、0.5mM dATP、1x末端转移酶反应缓冲液。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,加入所述反应溶液II后,所得的混合液中包括:10~14U末端转移酶、0.5mM dATP、1x末端转移酶反应缓冲液。
9.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,聚合反应条件为:37℃,40min。
10.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(b)中,聚合反应后还包括高温灭活步骤,条件为75℃,10min。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于重庆医科大学,未经重庆医科大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910222553.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种血液cfDNA提取试剂盒
- 下一篇:一种快速检测乳中单增李斯特活菌的方法