[发明专利]一种与甜瓜蔓长相关的分子标记及其在鉴定甜瓜蔓长性状中的应用有效

专利信息
申请号: 201910227204.1 申请日: 2019-03-25
公开(公告)号: CN109762928B 公开(公告)日: 2022-07-12
发明(设计)人: 马建;王建设;李丛丛 申请(专利权)人: 北京市农林科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 魏少伟
地址: 100097 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 瓜蔓 相关 分子 标记 及其 鉴定 性状 中的 应用
【权利要求书】:

1.甜瓜蔓长分子标记或检测所述甜瓜蔓长分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定甜瓜蔓长性状中的应用;所述甜瓜蔓长分子标记为序列表中序列1的第65-71位的核苷酸,甜瓜基因组DNA中对应于序列表中序列1所示的DNA片段含有序列表中序列1的第65-71位的核苷酸或不含有序列表中序列1的第65-71位的核苷酸。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述检测所述甜瓜蔓长分子标记的物质为引物对,所述引物对由名称分别为dm1-F和dm1-R的单链DNA组成,所述dm1-F为在甜瓜基因组中与序列1的第65位上游特异结合的单链DNA,所述dm1-R为在甜瓜基因组中与序列1的第71位下游特异结合的单链DNA。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述dm1-F为序列表中序列1的第1-25位所示的单链DNA;所述dm1-R为与序列表中序列1的第74-95位反向互补的单链DNA。

4.检测甜瓜基因型的方法,所述基因型为A1A1基因型、A1A2基因型和A2A2基因型,所述方法包括:检测待测甜瓜染色体中对应于序列表中序列1的第65-71位的核苷酸,如所述待测甜瓜两条染色体均为下述g1)的染色体,所述待测甜瓜为A1A1基因型甜瓜;如所述待测甜瓜两条染色体均为下述g2)的染色体,所述待测甜瓜为A2A2基因型甜瓜;如所述待测甜瓜两条染色体中一条为下述g1)的染色体,另一条为下述g2)的染色体,所述待测甜瓜为A1A2基因型甜瓜;

g1)含有序列表中序列1的第65-71位的核苷酸;

g2)不含序列表中序列1的第65-71位的核苷酸。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:检测待测甜瓜染色体中对应于序列表中序列1的第65-71位的核苷酸采用权利要求3中所述引物对进行,所述方法包括L1)和L2):

L1)以待测甜瓜基因组DNA为模板,采用权利要求3中所述引物对进行PCR扩增得到PCR产物;

L2)下述L21)或L22):

L21)检测步骤L1)得到的PCR产物的序列,根据所述PCR产物序列确定甜瓜基因型:如所述PCR产物中含有序列1所示的DNA片段、且不含有序列表中序列2所示的DNA片段,所述待测甜瓜为A1A1基因型甜瓜;如所述PCR产物中含有序列2所示的DNA片段、且不含有序列表中序列1所示的DNA片段,所述待测甜瓜为A2A2基因型甜瓜;如所述PCR产物中含有序列1和2所示的两种DNA片段,所述待测甜瓜为A1A2基因型甜瓜;

L22)检测步骤L1)得到的PCR产物的大小,根据所述PCR产物大小确定甜瓜基因型:如所述PCR产物中含有95bp的DNA片段、且不含有88bp的DNA片段,所述待测甜瓜为A1A1基因型甜瓜;如所述PCR产物中含有88bp的DNA片段、且不含有95bp的DNA片段,所述待测甜瓜为A2A2基因型甜瓜;如所述PCR产物中含有95bp和88bp两种大小的DNA片段,所述待测甜瓜为A1A2基因型甜瓜。

6.下述X1)或X2)或X3)的方法:

X1)鉴定甜瓜蔓长性状的方法,包括:按照权利要求4或5所述的方法检测待测甜瓜的基因型,A1A1基因型甜瓜蔓长长于或候选长于A2A2基因型甜瓜蔓长,A1A2基因型甜瓜蔓长长于或候选长于A2A2基因型甜瓜蔓长,A1A1基因型甜瓜蔓长与A1A2基因型甜瓜蔓长无差异或候选无差异;

X2)鉴定甜瓜蔓长性状的方法,包括:按照权利要求4或5所述的方法检测待测甜瓜的基因型,A1A1基因型甜瓜为或候选为长蔓长甜瓜,A1A2基因型甜瓜为或候选为长蔓长甜瓜,A2A2基因型甜瓜为或候选为短蔓长甜瓜;

X3)甜瓜育种方法,包括:按照权利要求4或5所述的方法检测甜瓜的基因型,选择A2A2基因型甜瓜作为亲本进行育种。

7.具有如下Y1)-Y4)中任一用途的物质,包括权利要求2或3中所述引物对:

Y1)检测甜瓜蔓长分子标记;

Y2)制备检测甜瓜蔓长分子标记的产品;

Y3)鉴定或辅助鉴定甜瓜蔓长性状;

Y4)制备鉴定或辅助鉴定甜瓜蔓长性状产品。

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